通过Python子进程与R脚本进行交互

Question

我想知道如何打开R脚本并与之交互（例如，发送字符串，整数等）。 尽管我以前没有使用过，但是子进程似乎是实现此目的的一种合理方法。

到目前为止，我有

process = subprocess.Popen(['/path/to/Rscript --no-save path/to/script.R'], stdout=subprocess.PIPE, stdin=subprocess.PIPE, shell=True)

这似乎在打开script.R时是成功的，但是在我的脚本中，我提示用户输入一个整数，因此我无法完全弄清如何执行此操作。 我努力了：

process.communicate(input=1)[0]

但我似乎在吠错树。 子进程关闭，但似乎没有收到此输入。

编辑：Rpy目前可能不是一个很好的选择，因为此脚本的用户不一定会访问该模块及其依赖项。

Answer 1

尝试PypeR吗？

在python通过管道使用R是一个很棒的接口。

Answer 2

编辑2

那个怎么样？

process = subprocess.Popen(['/path/to/Rscript', '--no-save', 'path/to/script.R'], stdout=subprocess.PIPE, stdin=subprocess.PIPE)

编辑1

您只能通过stdin和stdout在进程之间交换字符串。

process.communicate("1\\n")对您有帮助吗？