在MySQL服务器中安装Bioperl库

Question

我安装了Bioperl并正常工作。 然后安装Bio :: Tools :: Run :: Phylo :: Phyml，并且在终端上运行良好。

但是，当我从浏览器到使用CGI方法调用相同的脚本时，出现此错误：

无法在@INC中找到Bio / Tools / Run / Phylo / Phyml.pm（@INC包含：/ etc / perl /usr/local/lib/perl/5.14.2 /usr/local/share/perl/5.14。 2 / usr / lib / perl5 / usr / share / perl5 /usr/lib/perl/5.14 /usr/share/perl/5.14 / usr / local / lib / site_perl。/ etc / apache2）在/ var / www / Adol /mafToPhyML1.pl第14行。\\ nBEGIN失败-在/var/www/Adol/mafToPhyML1.pl第14行中中止了编译。

我从error.log收到此消息

Answer 1

这篇文章与您的问题类似。 您需要在cgi脚本中正确设置@INC 。 use lib包含Phyml.pm所在的Bio目录的目录将use lib pragma添加到您的cgi脚本中。