Scipy和Scikit中未定义的符号 - 在RedHat上学习

Question

我正在尝试在没有root权限的64位Red Hat Enterprise 6.6服务器上安装Scikit-Learn。 我已经完成了Python 2.7.9，Numpy 1.9.2，Scipy 0.15.1和Scikit-Learn 0.16.1的全新安装。 服务器上的Atlas BLAS安装是3.8.4。

我可以安装scikit-learn，但是当我尝试用Python导入它时，我得到了

File "<pyinstall>/site-packages/scipy/parse/linalg/isolve/_iterative.so: undefined symbol: slamch_"

同样，当我跑

>>> import scipy; scipy.test()

我得到16个错误，其中14个是以下未定义符号的ImportErrors：

• scipy/cluster/_vq.so: undefined symbol _gfortran_st_write_done
• scipy/special/_ufuncs.so: undefined symbol dstevr_
• scipy/linalg/_fblas.so: undefined symbol csyr_
• scipy/lib/blas/fblas.so: undefined symbol slamch_
• scipy/lib/lapack/flapack.so: undefined symbol sgbsv_
• scipy/spatial/qhull.so: undefined symbol _gfortran_st_write_done

我的研究我发现有几个来源提出这样的问题是因为Fortran编译器在编译BLAS / LAPack库和scipy时不匹配，例如这个邮件交换和2007年的另一个（没有链接，因为我的声誉不够高包含另一个链接;它引用了_gfortran_st_write_done符号）。 但是，BLAS构建是在只安装了gfortran的服务器上完成的（没有g77或Intel编译器），我重新编译scipy以明确使用gfortran。

scipy安装说明还提到Atlas BLAS附带的LAPACK版本不是完整的实现，并且如果安装的LAPACK缺少某些功能，则可能会出现ImportErrors。 所以，我按照这里的说明安装了完整版的LAPACK 3.5.0，也是用gfortran编译的。 然后我重新编译scipy和sklearn指向更新的库，并收到相同的导入错误。

我的问题除了不匹配的Fortran编译器之外，还有什么可能导致这些错误吗？ 或者，是否有另一个我需要重新编译的库？

Answer 1

感谢Andreas Mueller提示：在本地安装的anaconda安装到我所拥有的目录中解决了编译问题。