将边缘权重分配给 R 中的 igraph 对象

Question

我有一个共现矩阵，我想将其转换为 igraph 对象。 该矩阵具有三列 - node1 、 node2和freq 。

我已经使用graph_from_edgelist命令创建了图形。

g <- graph_from_edgelist(as.matrix(coOccurDf[1:n,1:2]), directed=F)

我现在需要为边缘分配权重。 我尝试使用两个函数，它们似乎都在做同样的工作，但无济于事。

set.edge.attribute(g, "weight", index=E(g), coOccurDf[1:n,]$freq)

和

set_edge_attr(g, "weight", index=E(g), coOccurDf[1:n,]$freq)

这两个命令都不会引发错误，但是当我尝试使用

E(g)$weight

它只显示NULL 。

任何帮助，将不胜感激。

Answer 1

您可以按如下方式返回igraph对象的权重：

edge.attributes(g)$weight

E(g)$weight

您可以通过分配给以下任一对象来设置igraph对象的权重：

edge.attributes(g)$weight <- coOccurDf[1:n,]$freq

E(g)$weight <- coOccurDf[1:n,]$freq

要使用set.edge.attribute函数，它会返回一个分配了权重的新图。 要将其分配给对象g而不是将加权图打印到控制台：

g <- set.edge.attribute(g, "weight", index=E(g), coOccurDf[1:n,]$freq)