有人可以解释R中pvclust函数的输出吗？

Question

在R中的pvclust包中，有pvclust()函数。 在函数帮助文件中提供的示例中，有以下函数：

boston.pp <- pvpick(boston.pv)

这应该打印出具有高p值的聚类。 该函数的输出是：

$clusters
$clusters[[1]]
[1] "rm"   "medv"

$clusters[[2]]
[1] "zn"  "dis"

$clusters[[3]]
[1] "crim"    "indus"   "nox"     "age"     "rad"     "tax"     "ptratio" "lstat"  


$edges
[1] 3 5 9

我很难理解输出的含义，特别是因为我对聚类分析的技术背景非常有限。 特别是，我不理解每个集群下名称向量的含义。 有人可以帮我解释一下吗？ 谢谢！

Answer 1

https://cran.r-project.org/web/packages/pvclust/pvclust.pdf描述了pvclust：

对于表示为（nxp）矩阵或数据帧的数据，我们假设数据是p个对象的n个观察值，这些对象将被聚类。 第i行向量对应于对这些对象的第i次观察，第j列向量对应于大小为n的第j个对象的样本

输出pvpick：

cluster - 字符串向量列表。 每个向量对应于每个群集中对象的名称。

你有没有绘制pvclust输出的树形图？ pvpick clusters输出只列出内部点（pvclust将波士顿数据集中的每一列视为一个点）在某些群集中，如果绘制它，您将在树形图中看到它。