有人可以解釋R中pvclust函數的輸出嗎？

Question

在R中的pvclust包中，有pvclust()函數。 在函數幫助文件中提供的示例中，有以下函數：

boston.pp <- pvpick(boston.pv)

這應該打印出具有高p值的聚類。 該函數的輸出是：

$clusters
$clusters[[1]]
[1] "rm"   "medv"

$clusters[[2]]
[1] "zn"  "dis"

$clusters[[3]]
[1] "crim"    "indus"   "nox"     "age"     "rad"     "tax"     "ptratio" "lstat"  


$edges
[1] 3 5 9

我很難理解輸出的含義，特別是因為我對聚類分析的技術背景非常有限。 特別是，我不理解每個集群下名稱向量的含義。 有人可以幫我解釋一下嗎？ 謝謝！

Answer 1

https://cran.r-project.org/web/packages/pvclust/pvclust.pdf描述了pvclust：

對於表示為（nxp）矩陣或數據幀的數據，我們假設數據是p個對象的n個觀察值，這些對象將被聚類。 第i行向量對應於對這些對象的第i次觀察，第j列向量對應於大小為n的第j個對象的樣本

輸出pvpick：

cluster - 字符串向量列表。 每個向量對應於每個群集中對象的名稱。

你有沒有繪制pvclust輸出的樹形圖？ pvpick clusters輸出只列出內部點（pvclust將波士頓數據集中的每一列視為一個點）在某些群集中，如果繪制它，您將在樹形圖中看到它。