igraph：从顶点 igraph r 开始查找连续连接的顶点

Question

输入：

data.frame(from = c(NA, 2, 4, 5, 8, 8, 1),
           to   = c(1, 3, 7, 6, 9, 10, 11))


 from to
   NA  1
    2  3
    4  7
    5  6
    8  9
    8 10
    1 11

我想知道如何使用igraph选择一个起始顶点，并获取所有连续连接的顶点。

例子

select(2) -> c(2, 3)
select(4) -> c(4, 7)
select(1) -> c(1, 11)
select(8) -> c(8, 9, 10)

这个想法是：我不知道结束顶点，我只知道起点，我想返回从这一点开始的连续路径

Answer 1

您可以使用ego或all_simple_paths来查找连接的节点，根据您的需要，这些节点的输出略有不同。（ ego在一个字符串中给出指定深度的邻居，而all_simple_paths按路径方向分隔节点）

#Your example

library(igraph)

g <- graph_from_data_frame(data.frame(from = c(NA, 2, 4, 5, 8, 8, 1),
           to   = c(1, 3, 7, 6, 9, 10, 11)))

 all_simple_paths(g, "2")
# [[1]]
# + 2/12 vertices, named:
# [1] 2 3

 ego(g, length(V(g)), "2")
# [[1]]
# + 2/12 vertices, named:
# [1] 2 3

全部一起：

ego(g, length(V(g)), as.character(c(1,2,4,8)))

或者

lapply(as.character(c(1,2,4,8)) , function(x) all_simple_paths(g, from=x))