不同矩阵之间的相关性R

Question

我正在尝试在R中的两个不同矩阵（业务分类单位与环境参数）之间创建一个关联（具有p值）

第一张桌子是这个

biotic1 biotic2 T1 1.540184 3.080025 T2 1.354927 5.012977 T3 1.449712 4.715981 T4 1.146659 2.442083 X1 1.705184 3.881878 X2 1.182721 3.014836 X3 1.536956 2.636719 X4 1.808025 4.434525 A1 1.132737 2.135737 A2 1.506048 3.114281 A3 1.285308 4.363828 A4

第二张桌子

OTU1 OTU2 OTU3 OTU4 OTU5 OTU6 OTU7 OTU8 T1 109 80 175 14 71 46 61 39 T2 102 48 26 8 23 5 35 10 T3 26 19 61 3 68 13 10 29 T4 143 56 9 11 16 13 49 24 X1 70 36 20 15 39 9 26 12 X2 39 33 12 32 15 2 11 3 X3 43 17 2 14 8 2 7 2 X4 160 60 8 26 25 7 9 15 A1 90 73 41 15 22 23 33 7 A2 344 109 18 28 22 13 93 16 A3 65 16 15 9 5 10 18 6 A4 141140 6 86 18 3 43 4

我已经尝试过cor（）和corr.test（），但是只能看到将第一个表中的值相关联

有什么建议吗？

非常感谢你

F

Answer 1

我不清楚您期望得到什么结果。但是，如果要执行简单的相关性测试，则必须使矩阵具有矢量格式。 您可以尝试如下操作：

cor(c(as.matrix(your_matrix1)), c(as.matrix(your_matrix2)))

要么

cor.test(c(as.matrix(your_matrix1)), c(as.matrix(your_matrix2)))

并查看这些选项之一是否符合您的期望。

但是，对我而言，使用规范的相关分析来探索您的数据集更有意义。 使用基数R可以使用：

cancor(matrix1, matrix2)

您还可以使用一些具有一组工具的软件包来解释结果（例如， library(CCA) ）