如何从在Python中执行的R脚本返回多个对象

Question

因此，我努力使用rpy2包在R和Python之间集成一些工作流。

例如，假设我正在尝试运行一个在R中进行线性回归的Python脚本，并且我想返回该脚本的所有元素（实际上，我正在尝试做比这复杂得多的事情）。

我在Python中执行以下命令（调用R；这假定您已安装rpy2 ）：

import rpy2.robjects as ro
test = ro.r('''
            # Load in data
            df <- mtcars
            # Run regression
            out = lm(formula='mpg ~ cyl + hp + wt',data=df)
            ''')

现在呢？ 我有一个问题：

1. 如何从结果中提取各种元素？ 在R中，它们的输出将是out$coefficients和out$residuals等。我知道有关于此的文档，但是我有点迷失了。 理想情况下，我希望元素使用有用的格式，例如pandas数据框或索引列表等。

2. df怎样？ robjects.r()似乎只是保存您最后提供的所有内容，而丢弃其他所有内容。 我想我可以解决这个问题，但这并不理想。

3. 与2相关：有更好的方法吗？ 通常，如果有人可以为这种事情提出“最佳实践”，那将会很有帮助，因为我确信有很多人对使用Python感兴趣，但是偶尔会有一个非常自定义的函数需要使用R，但是他们不想看上这种集成。 使用Pythonic输入参数调用R函数的方法也许很棒。

Answer 1

问题1：如何从结果中提取各种元素？

答案1：运行R脚本后：

test = ro.r(your_R_script)

您可以使用此代码打印出test对象中的所有names和values 。

# iterate on names and values
# be careful output is v long
for n,v in test.items():
    print(n)
    print(v)

要列出所有可用names ，请运行以下代码：

test.names

输出：

StrVector with 12 elements.
'coeffici... 'residuals' 'effects' 'rank' ... 'xlevels' 'call'  'terms' 'model'

要打印“残差”的值，请运行以下命令：

test[test.names.index('residuals')]

问题2：df会怎样？

回答2：在您删除它之前，它在R环境中仍然可用。 您可以运行简单的R代码来检查：

ro.r('''
        # View dataframe
        df
        ''')

Q.3：有更好的方法吗？

答案3 ：（无答案。）