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ojalgo 中的稀疏矩阵分解

[英]Sparse Matrix Decomposition in ojalgo

我想用 ojalgo 做最小二乘调整。 问题是我的 Designmatrix 非常大(超过 100kx100k)但非常稀疏。 用 ojalgo 建立巨大的稀疏矩阵是没有问题的。 还要做一些基本的数学运算。 当我从 SparseStore 矩阵创建 QR 对象时,似乎忽略了 SparseStore 矩阵信息,并且 qr 对象被初始化为 2D-DenseMatrix 对象。 当然比我的系统内存不足。

是否有可能执行 qr(或其他)操作来保持 SparseStore。

谢谢你的帮助,

最好的,罗尼

源代码:

package matrixTest;
import static org.ojalgo.type.CalendarDateUnit.*;

import java.util.Random;

import org.ojalgo.OjAlgoUtils;
import org.ojalgo.array.LongToNumberMap;
import org.ojalgo.array.Primitive64Array;
import org.ojalgo.array.SparseArray;
import org.ojalgo.matrix.decomposition.QR;
import org.ojalgo.matrix.store.MatrixStore;
import org.ojalgo.matrix.store.SparseStore;
import org.ojalgo.matrix.task.iterative.ConjugateGradientSolver;
import org.ojalgo.netio.BasicLogger;
import org.ojalgo.series.BasicSeries;
import org.ojalgo.type.Stopwatch;

/**
 * Example use of SparseStore and other special MatrixStore implementations.
 *
 * @see https://www.ojalgo.org/2020/09/sparse-and-special-structure-matrices/
 * @see https://github.com/optimatika/ojAlgo/wiki/Sparse-Matrices
 */
public class SparseMatrices {

    private static String NON_ZEROS = "{} non-zeroes out of {} matrix elements calculated in {}";
    private static Random RANDOM = new Random();

    public static void main(final String[] args) {

        BasicLogger.debug();
        BasicLogger.debug(SparseMatrices.class);
        BasicLogger.debug(OjAlgoUtils.getTitle());
        BasicLogger.debug(OjAlgoUtils.getDate());
        BasicLogger.debug();

        int dim = 100_000;

        SparseStore<Double> mtrxD = SparseStore.PRIMITIVE64.make(dim, dim);

        for (int j = 0; j < dim; j++) {
            double val = RANDOM.nextDouble();
            mtrxD.set(j, j, val);
        } // Each column of B contains 1 non-zero element at random row

        QR<Double> decompQR = QR.PRIMITIVE.make(mtrxD);

        
        stopwatch.reset();
        decompQR.compute(mtrxD);
        BasicLogger.debug("Sparse Identity decomposed (QR) in {}", stopwatch.stop());

    }

}

目前没有保留稀疏性的矩阵分解。

不确定您需要什么或 ojAlgo 中的确切内容。 您可以乘以转置矩阵,然后使用迭代求解器吗?

暂无
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