ModuleNotFoundError：尽管安装了模块，但没有名为“tf_slim”的模块

Question

我想从deepvariant call_variants.py 我在安装 cuda、tensorflow 等时苦苦挣扎了好几个小时……不幸的是，我遇到了一个问题，我不知道该怎么办。 让我们从头开始：

conda create --name tf tensorflow
conda activate tf
python --version
Python 3.7.9
python3 -c 'import tensorflow as tf; print(tf.__version__)'
2.3.0

现在我尝试运行命令：

python ${h_dir}/deepvariant/binaries/DeepVariant/1.0.0/DeepVariant-1.0.0/call_variants.zip \
--outfile ${test_dir}/test.gz \
--examples ${ex_dir}/ex_test.gz --checkpoint $model

我有：

Traceback (most recent call last):
  File "/tmp/Bazel.runfiles_i55m5mpq/runfiles/com_google_deepvariant/deepvariant/call_variants.py", line 57, in <module>
    from deepvariant import modeling
  File "/tmp/Bazel.runfiles_i55m5mpq/runfiles/com_google_deepvariant/deepvariant/modeling.py", line 51, in <module>
    import tf_slim
ModuleNotFoundError: No module named 'tf_slim'

所以我当然决定安装它：

pip install tf_slim
Collecting tf_slim
  Using cached tf_slim-1.1.0-py2.py3-none-any.whl (352 kB)
Requirement already satisfied: absl-py>=0.2.2 in ./anaconda3/envs/tf/lib/python3.7/site-packages (from tf_slim) (0.11.0)
Requirement already satisfied: six in ./anaconda3/envs/tf/lib/python3.7/site-packages (from absl-py>=0.2.2->tf_slim) (1.15.0)
Installing collected packages: tf-slim
Successfully installed tf-slim-1.1.0

然而：

python3 -c 'import tf_slim as slim; print(slim.__version__)'
Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 1, in <module>
AttributeError: module 'tf_slim' has no attribute '__version__'

当然ModuleNotFoundError: No module named 'tf_slim'运行命令后。 所以也许用 conda 安装？

conda install -c conda-forge tf-slim

但它根本没有帮助......我不知道下一步该怎么做，期待任何想法！

编辑：当我运行这样的事情时：

try:
    import tf_slim as slim
    print("module 'tf_slim' is installed")
except ModuleNotFoundError:
    print("module 'tf_slim' is not installed")

python test.py
module 'tf_slim' is installed

但是在命令之后，仍然是ModuleNotFoundError: No module named 'tf_slim'

¯_(ツ)_/¯

Answer 1

好的，我想我明白了。 如您所见，我使用 conda 为 tensorflow 创建环境。 正如我所读到的，建议使用此过程，否则您可能会遇到类似ModuleNotFoundError: No module named 'tensorflow' which has been described here之类的问题。 那我做了什么？ 我停用并删除了任何 conda 环境，我决定在没有它的情况下运行我的命令，就在终端中。 首先，但是我使用python3运行命令然后我发生了与ModuleNotFoundError: No module named 'tf_slim'相同的错误，我使用pip3 install tf_slim安装了它并且它工作正常。 接下来，我运行 deepvariant 脚本 postprocess_variants.py，我遇到了与altair模块相同的问题，但我做了同样的事情，两个命令都有效！

Answer 2

只需卸载tf_slim ，然后再次安装tf_slim package，它就可以工作了。