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[英]R: plotting posterior classification probabilities of a linear discriminant analysis in ggplot2
[英]ggplot - plotting posterior probabilities with gradient colouring
使用下面的代碼,我將數據集分為兩個類,然后對點進行ggplot
,將每個顏色標記為1或2類。
問題:我該如何使用漸變着色顯示屬於第2類的每個點的后驗概率data_f.k2$posterior
? 在問題的底部,我分享了使用scale_colour_gradient
嘗試,該方法不起作用。
if(!require("mixtools")) { install.packages("mixtools"); require("mixtools") }
data_f <- faithful
# fit gaussian mixture model
data_f.k2 = mvnormalmixEM(as.matrix(data_f), k=2, maxit=100, epsilon=0.01)
faithful.classes <- apply(data_f.k2$posterior,1,which.max)
# ggplot maximum a posteriori estimations per observation
map_mixtures <- ggplot(data= data_f, aes(x=eruptions, y=waiting)) +
geom_point( aes(colour=factor(faithful.classes))) +
這將產生下圖:
這是我嘗試獲得后漸變色的方法,該方法不起作用。 我希望顏色褪色,例如從紅色變為藍色-中間的點(可能屬於這兩種混合物)為紫色。
data_f$posterior2 <- data_f.k2$posterior[,'comp.2']
ggplot(data= data_f,aes(x=eruptions, y=waiting)) +
geom_point(aes(fill=posterior2), colour="grey80" ) +
scale_fill_gradient ('posterior2', low = "red", high = "blue")
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