使用Matplotlib更改圖形中的顏色以繪制Pandas數據框

Question

所以我有一個數據框，使用下面的代碼可以繪制出來，看起來很棒。 問題在於，在數據框中有大約10種顏色被使用並重復用於多種輸入，因此不可能將一個數據框條目與其他20種顏色區分開。

我認為必須有某種方式聲明“使用X配色方案並允許60種顏色”，但我不知道如何使用數據框。

dataframe = pd.DataFrame(new_vals)
dataframe.plot(kind='bar',stacked=True,legend=False, ylim=(0,100),title='Taxonomic analysis of samples')

N = 29
ind = np.arange(N)
width = 0.35




plt.xlabel('Sample')
plt.ylabel('Percentage of assembly atrribted to each taxonomic group (%)')
plt.legend(loc="best", bbox_to_anchor=(1.0, 1.00))
plt.xticks(ind+width/2. - 0.2,('B11', 'B2', 'B3', 'B4', 'B5', 'B6', 'B7', 'B8', 'B9', 'C10', 'C11', 'C2', 'C3', 'C4', 'C5', 'C6', 'C7', 'C8', 'C9', 'D10', 'D11', 'D2', 'D3', 'D4', 'D5', 'D6', 'D7', 'D8', 'D9'))

這是我的數據框示例；

    Other   actinomyces alcanivorax alkaliphilus    bacillus    bacteroides candidatus phytoplasma  cyanothece  enterobacter    escherichia ... neisseria   paenibacillus   porphyromonas   prevotella  pseudoalteromonas   rothia  staphylococcus  streptococcus   streptomyces    veillonella
0   26.229808   5.198240    4.694513    0.047974    3.691476    0.792203    2.782495    2.018697    2.180294    0.453228    ... 1.677198    4.944483    0.458910    5.496815    2.910004    0.372430    0.599676    8.276785    1.992817    0.595257
1   24.395006   11.615767   1.995668    0.069200    5.750399    0.921047    1.248692    0.740260    0.967860    1.904479    ... 0.873587    1.316648    0.261579    4.954371    1.348089    2.405995    1.061885    18.200302   1.660959    5.382657
2   22.078940   5.772762    3.107776    0.070983    5.523827    1.428608    1.846615    1.218850    1.542251    1.656823    ... 0.986514    2.414715    0.617899    6.893698    2.014352    0.496304    1.056452    22.272679   1.470803    2.696270
3   33.438669   5.210649    0.043170    0.136277    7.108181    2.148167    0.071589    0.034340    0.073281    2.719497    ... 1.922939    0.111153    3.898990    6.426144    0.045960    4.365727    1.545480    17.170125   0.870670    3.480261
4   20.831026   3.001972    4.746576    0.034374    2.198009    0.677926    3.264413    2.524014    2.720162    0.563074    ... 1.167616    9.110402    0.358742    3.323339    3.180934    0.420669    0.408120    8.948355    1.856454    1.086865

Answer 1

IIUC您可以使用以下函數生成k種顏色的顏色圖：

def colormapgenerator(N, cm=None):

    base = plt.cm.get_cmap(cm)
    color_list = base(np.linspace(0, 1, N))
    cm_name = base.name + str(N)
    return base.from_list(cm_name, color_list, N)

其中cm是您想要的cmap （例如， Blues ， Reds等），而N是您需要的顏色數。 比嘗試將以下內容添加到您的dataframe.plot() ：

cmap=colormapgenerator(60, 'Reds')

希望能有所幫助。