在 Python Plotly 中按分類組繪圖

Question

我有一個只有 5 個變量的 Pandas 數據框。 我想通過分類變量創建散點圖和顏色。 我正在使用 plotly，所以我可以放大到特定區域。 Plotly 不允許我將分類變量列表作為顏色傳遞。 先感謝您！ 這是我的代碼：

import plotly.graph_objs as go
import plotly.plotly as py
import plotly.tools

plotly.tools.set_credentials_file(username='user', api_key='key')

trace1 = go.Scatter(
    x = df['var1'],
    y = df['var2'],
    mode='markers',
    marker=dict(
        size=16,
        color = df['categorialVar'], #set color equal to a variable
        showscale=True
    )
)
data = [trace1]

py.iplot(data, filename='scatter-plot-with-colorscale')

Answer 1

最近遇到了這個問題並提出了解決方案：

def get_random_qualitative_color_map(
        categorial_series: pd.Series,
        colors: typing.List[str] = plotly_colors.qualitative.Alphabet
) -> typing.List[str]:
    """
    Returns a color coding for a given series (one color for every unique value). Will repeat colors if not enough are
    provided.
    :param categorial_series: A series of categorial data
    :param colors: color codes (everything plotly accepts)
    :return: Array of colors matching the index of the objects
    """
    # get unique identifiers
    unique_series = categorial_series.unique()

    # create lookup table - colors will be repeated if not enough
    color_lookup_table = dict((value, color) for (value, color) in zip(unique_series, itertools.cycle(colors)))

    # look up the colors in the table
    return [color_lookup_table[key] for key in categorial_series]

• 如果顏色數組為空，則解決方案重復顏色
• 可以與任何調色板一起使用（在這種情況下 plot.ly Alphabet 是默認值）

解釋

unique_series = categorial_series.unique()

首先，我們獲得系列中的唯一值。 他們每個人都會匹配一種顏色。

color_lookup_table = dict((value, color) for (value, color) in zip(unique_series, itertools.cycle(colors)))

接下來我們將創建一個 dict（用作查找表 - 我們可以查找哪種顏色屬於哪個類別元素。這里棘手的部分是使用itertools.cycle(colors) 。該函數將返回一個始終循環的迭代器給定迭代中的所有值（在這種情況下是由 plot.ly 定義的顏色列表）。

接下來我們將zip這個迭代器和實際的唯一項。 這將創建成對 (unique_item, color)。 我們得到了永遠不會用完顏色的好效果（因為循環迭代器將無休止地運行）。 這意味着返回的 dict 將有len(unique_series)項。

[color_lookup_table[key] for key in categorial_series]

最后，我們使用列表推導在查找表中查找系列中的每個條目。 這將創建數據點的顏色列表。 然后，該列表可以用作任何plotly.graphics_object標記字典中的color參數的參數。

Answer 2

因此，我沒有繼續尋找 plotly 的解決方案，而是繼續使用 seaborn 可視化庫，並添加了“%matplotlib notebook”，它工作得很好而且很容易。

%matplotlib notebook

# Plot t-SNE
sns.set_context("notebook", font_scale=1.1)
sns.set_style("ticks")

sns.lmplot(x='var1',
       y='var2',
       data=tsne_out,
       fit_reg=False,
       legend=True,
       size=9,
       hue='categorialVar',
       scatter_kws={"s":200, "alpha":0.3})

plt.title('Plot Title', weight='bold').set_fontsize('14')
plt.xlabel('Dimension 1', weight='bold').set_fontsize('10')
plt.ylabel('Dimension 2', weight='bold').set_fontsize('10')