在 Python Plotly 中按分类组绘图

Question

我有一个只有 5 个变量的 Pandas 数据框。 我想通过分类变量创建散点图和颜色。 我正在使用 plotly，所以我可以放大到特定区域。 Plotly 不允许我将分类变量列表作为颜色传递。 先感谢您！ 这是我的代码：

import plotly.graph_objs as go
import plotly.plotly as py
import plotly.tools

plotly.tools.set_credentials_file(username='user', api_key='key')

trace1 = go.Scatter(
    x = df['var1'],
    y = df['var2'],
    mode='markers',
    marker=dict(
        size=16,
        color = df['categorialVar'], #set color equal to a variable
        showscale=True
    )
)
data = [trace1]

py.iplot(data, filename='scatter-plot-with-colorscale')

Answer 1

最近遇到了这个问题并提出了解决方案：

def get_random_qualitative_color_map(
        categorial_series: pd.Series,
        colors: typing.List[str] = plotly_colors.qualitative.Alphabet
) -> typing.List[str]:
    """
    Returns a color coding for a given series (one color for every unique value). Will repeat colors if not enough are
    provided.
    :param categorial_series: A series of categorial data
    :param colors: color codes (everything plotly accepts)
    :return: Array of colors matching the index of the objects
    """
    # get unique identifiers
    unique_series = categorial_series.unique()

    # create lookup table - colors will be repeated if not enough
    color_lookup_table = dict((value, color) for (value, color) in zip(unique_series, itertools.cycle(colors)))

    # look up the colors in the table
    return [color_lookup_table[key] for key in categorial_series]

• 如果颜色数组为空，则解决方案重复颜色
• 可以与任何调色板一起使用（在这种情况下 plot.ly Alphabet 是默认值）

解释

unique_series = categorial_series.unique()

首先，我们获得系列中的唯一值。 他们每个人都会匹配一种颜色。

color_lookup_table = dict((value, color) for (value, color) in zip(unique_series, itertools.cycle(colors)))

接下来我们将创建一个 dict（用作查找表 - 我们可以查找哪种颜色属于哪个类别元素。这里棘手的部分是使用itertools.cycle(colors) 。该函数将返回一个始终循环的迭代器给定迭代中的所有值（在这种情况下是由 plot.ly 定义的颜色列表）。

接下来我们将zip这个迭代器和实际的唯一项。 这将创建成对 (unique_item, color)。 我们得到了永远不会用完颜色的好效果（因为循环迭代器将无休止地运行）。 这意味着返回的 dict 将有len(unique_series)项。

[color_lookup_table[key] for key in categorial_series]

最后，我们使用列表推导在查找表中查找系列中的每个条目。 这将创建数据点的颜色列表。 然后，该列表可以用作任何plotly.graphics_object标记字典中的color参数的参数。

Answer 2

因此，我没有继续寻找 plotly 的解决方案，而是继续使用 seaborn 可视化库，并添加了“%matplotlib notebook”，它工作得很好而且很容易。

%matplotlib notebook

# Plot t-SNE
sns.set_context("notebook", font_scale=1.1)
sns.set_style("ticks")

sns.lmplot(x='var1',
       y='var2',
       data=tsne_out,
       fit_reg=False,
       legend=True,
       size=9,
       hue='categorialVar',
       scatter_kws={"s":200, "alpha":0.3})

plt.title('Plot Title', weight='bold').set_fontsize('14')
plt.xlabel('Dimension 1', weight='bold').set_fontsize('10')
plt.ylabel('Dimension 2', weight='bold').set_fontsize('10')