如何使用python合並多個.h5文件（但形狀相同）？

Question

如何使用python合並多個.h5文件（但形狀相同）？

我有10,000個.h5文件用於3D點雲。

它們具有相同的形狀。

我想合並（或合並）2000個文件，所以我總共可以有5個大.h5文件。 （例如python中的append（）函數）

我從h5py（ http://docs.h5py.org/en/latest/high/group.html ）找到了copy（）函數。

但是，我無法將該方法應用於我的問題。

請參考我的示例代碼或幫助我解決問題。

對不起，我英語水平差。

Answer 1

您可以簡單地執行以下操作（未經測試但應該可以）：

import h5py

def copy(dest, name):
    g = dest.require_group(name)  # create output group with the name of input file
    def callback(name, node):
        if isinstance(node, h5py.Dataset):  # only copy dataset
            g.create(name, data=node[:])

with h5py.File('out.h5', 'w') as h5_out:
    for f_in in files:
        with h5py.File(f_in, 'r') as h5_in:
                h5_in.visititems(copy(h5_out, f_in))

這將為每個文件創建一個“文件夾”（HDF5組），然后遞歸復制所有內容。

另請參閱： 相關問題 。