使用 reticulate 在 RStudio 和 shiny 應用程序中運行 python 腳本時出錯

Question

我有一個 python 腳本，其中我使用“adtk”package 定義了一個 function。 使用網狀，我從 R 調用我的 function 並將其應用於一些數據。 這完全沒有錯誤。 但是，當我嘗試在 shiny 應用程序中做完全相同的事情時，它給了我以下錯誤：模塊 adtk 沒有屬性轉換器！

RStudio代碼片：

library(reticulate)
use_condaenv('my_conda_env')
source_python("my_python_script.py")

Python 腳本：

import adtk

def my_func():
  adtk.transformer.DoubleRollingAggregate()
  ...

Answer 1

聽起來在本地運行您的代碼可能會無意中使用您的系統 Python （及其 adtk 包），而不是使用您的 conda 環境，它可能缺少 adtk 和/或其某些模塊。

當您運行library(reticulate)時，網狀 package 將嘗試初始化其最佳猜測版本的 Python，這可能不是您打算使用的版本。 由於 Python 已經為您的 session 初始化，之后運行use_condaenv('my_conda_env')可能會被忽略。 （您可以通過嘗試運行use_condaenv('my_conda_env', required = TRUE)來測試它，而不是查看是否收到類似於以下內容的錯誤： The requested version of Python (<conda env python path>) cannot be used, as another version of Python (<system python path>) has already been initialized. ）

要強制您的代碼在您的 conda 環境中運行，請重新啟動 R session 並運行reticulate::use_condaenv('my_conda_env', required = TRUE) 。 通過運行reticulate::py_config()確認正在使用環境。

您可以通過查看已安裝的軟件包來仔細檢查您的 conda 環境中是否安裝了正確版本的 adtk。 最后，確保在您運行 Shiny 應用程序的系統上支持 conda（例如， 在 shinyapps.io 目前不支持 conda ，但您可以改用 virtualenv。）