使用 reticulate 在 RStudio 和 shiny 应用程序中运行 python 脚本时出错

Question

我有一个 python 脚本，其中我使用“adtk”package 定义了一个 function。 使用网状，我从 R 调用我的 function 并将其应用于一些数据。 这完全没有错误。 但是，当我尝试在 shiny 应用程序中做完全相同的事情时，它给了我以下错误：模块 adtk 没有属性转换器！

RStudio代码片：

library(reticulate)
use_condaenv('my_conda_env')
source_python("my_python_script.py")

Python 脚本：

import adtk

def my_func():
  adtk.transformer.DoubleRollingAggregate()
  ...

Answer 1

听起来在本地运行您的代码可能会无意中使用您的系统 Python （及其 adtk 包），而不是使用您的 conda 环境，它可能缺少 adtk 和/或其某些模块。

当您运行library(reticulate)时，网状 package 将尝试初始化其最佳猜测版本的 Python，这可能不是您打算使用的版本。 由于 Python 已经为您的 session 初始化，之后运行use_condaenv('my_conda_env')可能会被忽略。 （您可以通过尝试运行use_condaenv('my_conda_env', required = TRUE)来测试它，而不是查看是否收到类似于以下内容的错误： The requested version of Python (<conda env python path>) cannot be used, as another version of Python (<system python path>) has already been initialized. ）

要强制您的代码在您的 conda 环境中运行，请重新启动 R session 并运行reticulate::use_condaenv('my_conda_env', required = TRUE) 。 通过运行reticulate::py_config()确认正在使用环境。

您可以通过查看已安装的软件包来仔细检查您的 conda 环境中是否安装了正确版本的 adtk。 最后，确保在您运行 Shiny 应用程序的系统上支持 conda（例如， 在 shinyapps.io 目前不支持 conda ，但您可以改用 virtualenv。）