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[英]How to apply a function for Spearman's rank correlation coefficient in R?
[英]Is there an R function for calculating Spearman correlation coefficient for each row in df and writing it as a vector?
我想知道是否有一個 R function 或 package 用於計算 df 中每一行的 Spearman 相關系數並將其寫為向量?
首先是可重現的示例:
deviation <- c(5.712840e-03, 5.712840e-02, 5.712840e-01, 5.712940e-01,5.712840e-06)
number <- c(45, 60, 16, 70, 19)
df <- data.frame(deviation, number)
我的 df 有 5 行 2 列。 我想計算每一行的 Spearman 相關性,以便稍后我可以在我的 df 中再添加一個具有 5 個 rho 的列。 我知道有一個計算相關系數的 function cor.test。 但是,它並不能幫助我解決我的任務,因為在它之后我只會得到一個系數
test <- cor.test(deviation, number, method="spearman")
test
它只會給出一個 rho。
請任何人向我推薦一些可以幫助解決此任務的 R 中的 package 或 function。
除了 Ben Bolker 的評論,我猜你正在尋找這樣的東西:
cor.test(df$deviation, df$number, method = "spearman")
給
Spearman's rank correlation rho
data: df$deviation and df$number
S = 12, p-value = 0.5167
alternative hypothesis: true rho is not equal to 0
sample estimates:
rho
0.4
為了將估計值放入數據框中,您可以使用broom
package 中的tidy()
:
library(broom)
cor.test(df$deviation, df$number, method = "spearman") %>% tidy()
給出:
# A tibble: 1 x 5
estimate statistic p.value method alternative
<dbl> <dbl> <dbl> <chr> <chr>
1 0.4 12 0.517 Spearman's rank correlation rho two.sided
然后您可以制作 function 並使用它:
cor_fun <- function(df) cor.test(df$deviation, df$number, method = "spearman") %>% tidy()
cor_fun(df)
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