使用兩個不同大小的熊貓數據框進行 Wilcoxon 測試

Question

我有兩個不同長度的數據幀（一個是 16，另一個是 28）。 我想使用scipy.stats.wilcoxon在這兩者之間進行 Wilcoxon 測試。 為此，我創建了一個函數：

def wilcoxon_test(df1, df2):

  list_col_1 = df1.columns
  list_col_2 = df2.columns

  for i in range(0, len(list_col_1)):
    name = list_col_1[i]
    for j in range(0, len(list_col_2)):
      name_check = list_col_2[j]
      if name_check == name:
        stat, pvalue = stats.wilcoxon(df1[name], df2[name_check])
        print("Wilcoxon test of {} and {}: stat = {}, pvalue = {}".format(name,name_check,stat,pvalue))
        if pvalue < 0.01:
          print("Pvalue between {} and {} < 0.01".format(name,name_check))

  return None

當數據具有相同大小時它運行良好，但我正在使用不同大小的數據幀，它給了我這個錯誤： ValueError: The samples x and y must have the same length.

我在這篇文章中看到在 R 上討論這個問題，你可以通過傳遞 paired: FALSE 來做到這一點。 通過這樣做，它相當於進行了 Mann-Whitney 檢驗。

有沒有辦法用 scipy.stats.wilocoxon 在 Python 上做同樣的事情，還是我應該直接使用scipy.stats.mannwhitneyu ？

謝謝

Answer 1

如果你想要一個非配對的威爾科克森測試，mannwhitneyu 似乎是正確的選擇。 在 mannwhitneyu 的 scipy 文檔中，您可以找到以下描述： mannwhitneyu is for independent samples. For related / paired samples, consider scipy.stats.wilcoxon. mannwhitneyu is for independent samples. For related / paired samples, consider scipy.stats.wilcoxon.