ggplot2中黃土方法的geom_smooth函數錯誤

Question

我正在使用 ggplot2 進行繪圖，但是當我使用方法 = loess 添加函數 geom_smooth 時，我的圖表不起作用。 實際上，它會創建與數據不匹配的曲線。 當我在腳本中更改這一行時，通過刪除它或使用另一種方法，圖表可以正常工作。

我已經檢查過我的數據是數字的，並且由於缺少小數而沒有極值，但事實並非如此。

我該如何糾正它以使我的 geom_smooth 與 loess 方法一起使用？

Answer 1

您的問題是loess的默認參數不適用於您的數據集。 您只有少量離散的x值，因此它不知道如何最好地擬合它。 例如，如果您查看base::loess()中的span的默認值（在ggplot2::geom_smooth(method = "loess") ），您會發現默認值為span = 0.75 。 如果你只是增加到span = 0.8 ，你會得到我認為更接近你想要的東西。 有關span參數的更多信息，您可以查看此答案。

library(tidyverse)

d %>% 
  ggplot(aes(x = quantity, y = fecundity, col = color)) +
  geom_jitter(size = 3) +
  geom_smooth(method = "loess", span = 0.8, alpha = 0.2) +
  scale_x_continuous(breaks=c(0.1,0.3,0.6,0.9,1.5), limits=c(0.1,1.5))+
  scale_colour_manual(values=c("20S" = "aquamarine1","25S" = "aquamarine3","28S" =
                                 "aquamarine4","20Y" = "darkgoldenrod1","25Y" = "darkgoldenrod3", "28Y" = "darkgoldenrod4"))+
  ggtitle("Fécondité en fonction du traitement de nourriture et de la température")+
  xlab("Quantité nutritionnelle") + ylab("Fécondité (nb d'oeufs/femelle)")+
  theme_grey(base_size = 22)

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Answer 2

您需要引用方法類型，例如使用geom_smooth(method="loess")