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我正在尝试找到一种将 numpy 数组转换为 hdf5 格式的方法 - I am trying to find a way to convert numpy array to hdf5 format

我正在尝试转换 Numpy arrays,它们是在 HDF5 格式中随时间变化的二维网格,适用于多种情况,例如 Numpy 数组具有以下方面:案例编号 (0-100)、时间 (0-200 年)、X 网格点位置(0-100m),y 网格点位置(0-20m)加上该位置的实际数据点(例如饱和度范围为 0- ...

Append HDF5 文件中的数据 - Append Data in HDF5 file

我想 append 新日期到我已经创建的 HDF5 文件,但我不知道如何 append 更多数据,我不知道附加的实际语法我已经创建了一个 HDF5 文件来将我的数据以 HDF 格式保存为with h5py.File(save_path+'PIC200829_256x256x256x3_fast_sj ...

在 Databricks 集群中使用 hdf 文件 - Working with hdf files in Databricks cluster

我正在尝试在 Databricks 环境中创建一个 simple.hdf。 我可以在驱动程序上创建文件,但是当使用 rdd.map() 执行相同的代码时,它会抛出以下异常。 我可以在 worker 上写入相同的文件并将文件复制回 /dbfs/mnt。 但是,我一直在寻找一种方法,通过它我可以直接通过 ...

如何根据文件名中的日期合并h5数据numpy arrays? - How to combine h5 data numpy arrays based on date in filename?

我有数百个 .h5 文件,文件名中有日期(例如 ..20221017...)。 对于每个文件,我都将一些参数提取到格式为 numpy 的数组中 代表感兴趣的数据。 我想按月对数据进行分组,所以我没有(例如)30 个 arrays 一个月,而是有 1 个数组代表 30 个 arrays 的平均值。我 ...

h5 文件中的更改未反映在 xdmf 文件中 - Changes in h5 file arent refelcted in xdmf file

您好,我收到了一个 h5 文件,其中包含一个与之关联的 xdmf 文件。 可视化看起来像这样。 这里的颜色只是特征 ID。 我想在 h5 文件中添加一些数据,以便能够在 paraview 中对其进行可视化。 新添加的数据不会出现在 paraview 中,尽管在使用hdfview时明显存在。 我要添加 ...

如何在 Mac 上完全编译和安装 mathGL? - How to completely complie and install mathGL on Mac?

请让我知道是否有任何方法可以让 MathGL 在我的计算机上运行。 如果以下测试中有任何错误,请告诉我。 谢谢你。 好的,我已经为这个问题苦苦挣扎了很长时间。 当我尝试从 C/Fortran 代码中可视化我的结果时,会发生以下情况。基本信息是: 案例一:默认制作 这看起来像一个最小的安装。 ...

pandas dataframe 与包含行 'nan' 的字符串索引在保存到 hd5 和从 hd5 读取时被转换为 NaN - pandas dataframe with string index containing row 'nan' gets converted to NaN when saved to and read from hd5

我有一个带有字符串索引的简单 dataframe : 它正确地将索引设置为字符串。 但是,当我将它保存到 hdf5 文件并再次读取时,它以某种方式将索引条目“nan”更改为 NaN。 有没有办法避免这种转换? 在我的实际代码中,索引是基于果蝇基因nan的,我不希望它被转换。 ...

Python 的 numpy 数组与 HDF 文件之间的双精度数,无需进行不必要的转换 - Python's numpy array of doubles to and from a HDF file without unnecessary conversions

我有一个 numpy 双打数组。 np.array([double1, double2, double3, ... , doublen]) 所有数组的元素在 memory 中都是连续的。 我想使用 HDF 文件作为数据容器(保存/加载)。 保存实现为: hdf.create_dataset(nam ...

将 HDF 数据读取到 3d 数组并在 python 中另存为数据帧 - Read a HDF data to a 3d array and save as a dataframe in python

我目前在做 NASA 气溶胶光学深度数据(MCD19A2),这是 NASA 卫星三级产品。 我已经上传了数据。 我想将数据保存为一个数据框,包括经度和纬度的所有信息以及值。 我已经成功将 0.47um 波段文件转换为三维数组。 我想问一下如何将此数组转换为正确的数据帧,包括 X、Y 和值。 以下是 ...

Pandas HDFStore 缓存 - Pandas HDFStore caching

我正在使用一个中等大小的数据集,其中包含大约 150 个 HDF 文件,每个文件 0.5GB。 有一个预定的进程使用store.append的pd.HDFStore更新这些文件。 我正在尝试实现以下场景:对于 HDF 文件: 保持更新商店的进程运行 以只读模式打开商店 运行一个 whil ...

使用 pandas 从谷歌云存储读取 hdf 文件 - read hdf file from google cloud storage using pandas

问候编码员和谷歌云开发人员和专业人士。 我正在尝试使用 pandas 提供的内置方法“pd.read_hdf()”从谷歌云存储中读取 hdf 文件列表,其中文件名是这样的(“client1.h”)。 我的问题是我总是得到这个错误: 在不同的论坛和网站深入搜索后,我意识到许多人遇到了同样的问题,但没有 ...

如何使用下面提供的代码创建 R 循环? - How can I create an R loop with the code provided below?

请,我需要帮助来创建一个循环,该循环将在包含 R 中的 483 个文件的 hdflist 上执行以下代码中显示的计算。 我添加了一个链接,其中包含两个.hdf 文件和用于试用的 shapefile。 该代码似乎适用于单个.hdf 文件,但我仍在为循环而苦苦挣扎。 谢谢 download files ...


 
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