我正在尝试转换 Numpy arrays,它们是在 HDF5 格式中随时间变化的二维网格,适用于多种情况,例如 Numpy 数组具有以下方面:案例编号 (0-100)、时间 (0-200 年)、X 网格点位置(0-100m),y 网格点位置(0-20m)加上该位置的实际数据点(例如饱和度范围为 0- ...
我正在尝试转换 Numpy arrays,它们是在 HDF5 格式中随时间变化的二维网格,适用于多种情况,例如 Numpy 数组具有以下方面:案例编号 (0-100)、时间 (0-200 年)、X 网格点位置(0-100m),y 网格点位置(0-20m)加上该位置的实际数据点(例如饱和度范围为 0- ...
我尝试在虚拟机 Linux #1 SMP Debian 5.10.140-1 (2022-09-02) 上从源代码构建 HDF5。 我遵循了基本说明: 配置步骤成功运行(在删除导致错误的文件中不需要的换行符 \r 之后,如1中所述)但 make 命令返回以下错误: ...
我有一个包含卫星数据的 HDF 文件,绘制时看起来像下面的附件图像。 它有很多坏像素(使用这个特定的颜色图时它们会变成黑色)。 例如,如何将坏像素的颜色更改为白色? 谢谢你。 HDF 文件链接: https://drive.google.com/file/d/1AYhvqxNlvlqQB7otn ...
我想 append 新日期到我已经创建的 HDF5 文件,但我不知道如何 append 更多数据,我不知道附加的实际语法我已经创建了一个 HDF5 文件来将我的数据以 HDF 格式保存为with h5py.File(save_path+'PIC200829_256x256x256x3_fast_sj ...
我正在尝试在 Databricks 环境中创建一个 simple.hdf。 我可以在驱动程序上创建文件,但是当使用 rdd.map() 执行相同的代码时,它会抛出以下异常。 我可以在 worker 上写入相同的文件并将文件复制回 /dbfs/mnt。 但是,我一直在寻找一种方法,通过它我可以直接通过 ...
我有数百个 .h5 文件,文件名中有日期(例如 ..20221017...)。 对于每个文件,我都将一些参数提取到格式为 numpy 的数组中 代表感兴趣的数据。 我想按月对数据进行分组,所以我没有(例如)30 个 arrays 一个月,而是有 1 个数组代表 30 个 arrays 的平均值。我 ...
如何使用 Python 中的 h5pyd 模块创建新文件夹? 例如,我有域/home/user/并且我想创建一个文件夹/home/user/data1/ 。 从命令行我可以使用以下命令:hstouch /home/user/data1/ h5pyd 中的等价物是什么? 有关我正在尝试做的事情的简 ...
您好,我收到了一个 h5 文件,其中包含一个与之关联的 xdmf 文件。 可视化看起来像这样。 这里的颜色只是特征 ID。 我想在 h5 文件中添加一些数据,以便能够在 paraview 中对其进行可视化。 新添加的数据不会出现在 paraview 中,尽管在使用hdfview时明显存在。 我要添加 ...
OSError:无法打开文件(未找到文件签名) 我觉得问题出在 .hdf 文件上,因为我没有 .h5 或 .hdf5 文件。 那么如何在 python 中打开 .hdf 呢? ...
请让我知道是否有任何方法可以让 MathGL 在我的计算机上运行。 如果以下测试中有任何错误,请告诉我。 谢谢你。 好的,我已经为这个问题苦苦挣扎了很长时间。 当我尝试从 C/Fortran 代码中可视化我的结果时,会发生以下情况。基本信息是: 案例一:默认制作 这看起来像一个最小的安装。 ...
一个可能很愚蠢的问题。 我想用 python 加载 MODIS hdf 数据。数据集可在 Earthdata 获得。 首先生成一个数据列表,它与 datetemp 相匹配。 现在我有 10 个文件的列表。 根据 Satpy 的介绍: 出现以下错误消息: 有任何想法吗? 谢谢。 ...
我有几个 hdf 文件,但我不知道如何在 python 中打开它们。 当我尝试通过 h5py.File(filename, 'r') 命令读取它时,它导致了 OSError。 ...
我有一个带有字符串索引的简单 dataframe : 它正确地将索引设置为字符串。 但是,当我将它保存到 hdf5 文件并再次读取时,它以某种方式将索引条目“nan”更改为 NaN。 有没有办法避免这种转换? 在我的实际代码中,索引是基于果蝇基因nan的,我不希望它被转换。 ...
我目前正在尝试了解 mpi4py。 我设置mpi4py.rc.initialize = False和mpi4py.rc.finalize = False因为我不明白我们为什么要自动初始化和完成。 默认行为是在导入 MPI 时调用MPI.Init() 。 我认为这样做的原因是因为对于每个等级,pyt ...
我有一个 numpy 双打数组。 np.array([double1, double2, double3, ... , doublen]) 所有数组的元素在 memory 中都是连续的。 我想使用 HDF 文件作为数据容器(保存/加载)。 保存实现为: hdf.create_dataset(nam ...
我目前在做 NASA 气溶胶光学深度数据(MCD19A2),这是 NASA 卫星三级产品。 我已经上传了数据。 我想将数据保存为一个数据框,包括经度和纬度的所有信息以及值。 我已经成功将 0.47um 波段文件转换为三维数组。 我想问一下如何将此数组转换为正确的数据帧,包括 X、Y 和值。 以下是 ...
我正在使用一个中等大小的数据集,其中包含大约 150 个 HDF 文件,每个文件 0.5GB。 有一个预定的进程使用store.append的pd.HDFStore更新这些文件。 我正在尝试实现以下场景:对于 HDF 文件: 保持更新商店的进程运行 以只读模式打开商店 运行一个 whil ...
我正在使用下面的命令创建一个H5数据集,该数据集使用dtype作为S10存储字符串数组。 create_dataset(dset_name, (0,) , dtype='S10', maxshape=None, chunks=True) 它将数据正确存储在hdf5文件的组中。 我什至可以在HDF ...
问候编码员和谷歌云开发人员和专业人士。 我正在尝试使用 pandas 提供的内置方法“pd.read_hdf()”从谷歌云存储中读取 hdf 文件列表,其中文件名是这样的(“client1.h”)。 我的问题是我总是得到这个错误: 在不同的论坛和网站深入搜索后,我意识到许多人遇到了同样的问题,但没有 ...
请,我需要帮助来创建一个循环,该循环将在包含 R 中的 483 个文件的 hdflist 上执行以下代码中显示的计算。 我添加了一个链接,其中包含两个.hdf 文件和用于试用的 shapefile。 该代码似乎适用于单个.hdf 文件,但我仍在为循环而苦苦挣扎。 谢谢 download files ...