[英]Create phylogenetic visualisation using ape package in R shiny
[英]How to include bootstrap values in phylogenetic trees in ape package
我正在使用R包ape
分析DNAbin对象中存储的一些序列:
library(ape)
my.seq <- read.dna("sequences.txt", format = "clustal")
my.dist <- dist.dna(my.seq)
my.tree <- nj(my.dist)
我想找到引导程序值,所以我使用boot.phylo:
boot <- boot.phylo(my.tree, my.seq, FUN = function(xx) nj(dist.dna(xx)), B = 100)
但是我收到一条错误消息:
Error in if (drop[j]) next : missing value where TRUE/FALSE needed
知道这意味着什么,以及如何解决? 我尝试使用Google搜索错误消息,但找不到任何东西。
您的if
条件导致NA
。
它必须具有TRUE
或FALSE
结果。
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