使用rpy2将.R文件中的源代码导入python

Question

在rpy 1.x中，要获取.R文件，所有人必须做的就是：

 import rpy rpy.r.source("filename.R") 

在rpy2中，为了从Python中获取.R文件需要发生什么？

我尝试了几种途径，例如：

 import rpy2.robjects as ro ro.source("filename.R") 

返回这样的错误（抱歉，如果格式不正确）：

File "C:\Python27\lib\site-packages\rpy2\robjects\functions.py", line 166, in __call__
return super(SignatureTranslatedFunction, self).__call__(*args, **kwargs)
File "C:\Python27\lib\site-packages\rpy2\robjects\functions.py", line 99, in __call__
res = super(Function, self).__call__(*new_args, **new_kwargs)
RRuntimeError: Error in file(filename, "r", encoding = encoding) : 
cannot open the connection

提前致谢...

Answer 1

您应该能够使用rpy2.robjects.r() （或.R() 运行任意R代码 ，不要认为存在差异）：

import rpy2.robjects as ro

ro.r("""source('filename.R')""")

我首先在RStudio（或您首选的替代方案）中测试filename.R ，只是为了确保它是一个有效的文件，并且可以没有问题地获取。