完全连接来自networkx中较大图形的子图

Question

我试着不要在这里重新发布，但我认为我的请求非常简单，我对网络图表缺乏经验。 在python中使用networkx模块时，我想从连接图中恢复所有节点相互连接的子图（节点数大于2的子图）。 有一个简单的方法吗？

这是我的例子：

一个包含七个节点的简单图表。 节点1,2,3是共享连接，节点1,2,4都共享连接，节点5,6,7都共享连接。

import networkx as nx
G=nx.Graph() #Make the graph
G.add_nodes_from([1,2,3,4,5,6,7]) #Add nodes, although redundant because of the line below
G.add_edges_from([(1,2),(1,3),(2,3),(1,4),(2,4),(1,5),(5,6),(5,7),(6,7)]) # Adding the edges

我想要的输出是：（[1,2,3]，[1,2,4]，[5,6,7]）

我可以想到写一些稍微费力的方法，但是想知道是否有一个简单的内置函数。

Answer 1

听起来您想要发现图表中的派系。 为此，您可以使用nx.clique.find_cliques() ：

>>> list(nx.clique.find_cliques(G))
[[1, 2, 3], [1, 2, 4], [1, 5], [6, 5, 7]]

nx.clique.find_cliques()返回一个生成器，它将生成图中的所有派系。 您可以使用列表推导过滤掉少于三个节点的派系：

>>> [g for g in nx.clique.find_cliques(G) if len(g) > 2]
[[1, 2, 3], [1, 2, 4], [6, 5, 7]]