在 Python 中运行 lmer（线性混合效应回归）

Question

我想问一些关于在 Python 中运行lmer （线性混合效应回归）模型的问题。

这是我在lme4包（在 R 中）中运行的两行（或公式）。 有什么方法可以在 Python 中安装如下模型？

1. TEST1 <- score ~ p1 + p2 + p3 + (1|v1) + (1|v2), data = df, control = lmerControl(boundary.tol = 1e-4, calc.derivs = FALSE))
2. TEST2 <- score ~ (1|v1) + (1|v2), data = df, control = lmerControl(boundary.tol = 1e-4, calc.derivs = FALSE))

Answer 1

If you aren't required to actually run the model in Python, you could call and run the LMER models in R directly from your Python environment.

您可以通过Rpy2 & rmagic 或Pymer4来做到这一点。 这两个选项都允许您在 R 中使用 lme4 package，并可以选择从 Python 环境（如 jupyter 笔记本）调用它们。

我写了一个教程，说明如何使用此处提供的示例执行此操作： https://towardsdatascience.com/how-to-run-linear-mixed-effects-models-in-python-jupyter-notebooks-4f8079c4b589

正如 EJJ 所指出的，在 Python 中有 LMER 的实现，例如在statsmodels和Tensorflow中，但它们的使用似乎不如上述方法直观。