在 Python 中運行 lmer（線性混合效應回歸）

Question

我想問一些關於在 Python 中運行lmer （線性混合效應回歸）模型的問題。

這是我在lme4包（在 R 中）中運行的兩行（或公式）。 有什么方法可以在 Python 中安裝如下模型？

1. TEST1 <- score ~ p1 + p2 + p3 + (1|v1) + (1|v2), data = df, control = lmerControl(boundary.tol = 1e-4, calc.derivs = FALSE))
2. TEST2 <- score ~ (1|v1) + (1|v2), data = df, control = lmerControl(boundary.tol = 1e-4, calc.derivs = FALSE))

Answer 1

If you aren't required to actually run the model in Python, you could call and run the LMER models in R directly from your Python environment.

您可以通過Rpy2 & rmagic 或Pymer4來做到這一點。 這兩個選項都允許您在 R 中使用 lme4 package，並可以選擇從 Python 環境（如 jupyter 筆記本）調用它們。

我寫了一個教程，說明如何使用此處提供的示例執行此操作： https://towardsdatascience.com/how-to-run-linear-mixed-effects-models-in-python-jupyter-notebooks-4f8079c4b589

正如 EJJ 所指出的，在 Python 中有 LMER 的實現，例如在statsmodels和Tensorflow中，但它們的使用似乎不如上述方法直觀。