R - gplots - 當key = FALSE時刪除heatmap.2中的空格

Question

我有：

library(gplots);
x<-matrix(seq(1:100),nrow=10,byrow=TRUE);
heatmap.2(x, Rowv=NA, Colv=NA, scale="none", main="This title will be cut off by the white space where the non-existant key is supposed to go.", col=gray((255:0)/255), dendrogram="none",trace="none", key=FALSE);

當鍵指定為FALSE時，在圖的左側有一塊空白區域，可防止顯示完整標題，與手動指定較小邊距沖突，並將熱圖移向右側。 使用"keysize=#"可以控制空白區域的寬度，但是使它太小（介於0.8和1.0之間）會產生錯誤： "Error in plot.new() : figure margins too large"

我會嘗試使用heatmap.2() heatmap()而不是heatmap.2() ，但是熱圖不能很好地用於項目所需的par() 。 如果有人有任何建議，我會很感激。

Answer 1

可以使用布局參數完成熱圖2的定位元素。

layout(mat = lmat, widths = lwid, heights = lhei)

我使用以下內容獲得了一個非常可接受的熱圖圖。

heatmap.2(x, 
    Rowv=NA, 
    Colv=NA, 
    scale="none", 
    main="This title will be cut off by the white space where the non-existant key is supposed to go.", 
    col=gray((255:0)/255), 
    dendrogram="none",
    trace="none", 
    key=FALSE, 
    lmat=rbind(c(2),c(3),c(1),c(4)), 
    lhei=c(1,1,9,0), 
    lwid=c(1)
    );

有關詳細信息，請參閱Stack Exchange上的 ?layout或此答案 。