實時3D散點圖

Question

我正在R中工作，並具有以下形式的數據。 第一列是一個人的生日，第二列是年齡，第三列是死亡原因（自然/疾病/事故），第四列是種族，第五列是出生時的體重，第六列是出生時的長度。

最終，我想創建一個簡短的視頻/時間流逝的3D圖，最后三列為空間尺寸。 視頻播放時間對應於收集我的數據的總時間。 視頻播放時，點會以黑點的形式彈出到其適當的3D位置，然后根據其死因變成藍色/綠色/紅色。

在追求這個想法時，我遇到了這個問題 ，但是它似乎是在實時地移動軸，而不是實時地填充圖形。 我擔心這從根本上是不同的任務。 我還看到jfreechart.com對此很有用，但我更喜歡在R / Matlab中在可能的情況下使用其他軟件來完成此操作。 最后，我願意使用/學習實現此目的所需的任何軟件。

感謝您抽出寶貴的時間！

Answer 1

這可以使用R包scatterplot3d和animation來完成。 后者需要安裝ImageMagick 。

這是一些代碼，可以完成您想要執行的操作。

require(animation)
require(scatterplot3d)

# Get some example data
n <- 10
dt <- data.frame(birth = rnorm(n, 50, 20),
                 age = sample(1:100, n, replace=TRUE), 
                 cause = sample(1:3, n, replace=TRUE), 
                 race = sample(1:5, n, replace=TRUE),
                 bweight = rnorm(n, 1000, 200),
                 blen = rnorm(n, 300, 20))

# Starting and final timepoint
st <- 1
ft <- 150

# All the timepoints to evaluate
times <- st:ft

# Matrices that show for each timepoint whether a person is alive or dead.
born <- outer(dt$birth, times, "<")
dead <- outer(dt$birth + dt$age, times, "<")

# Matrix is 0 for not yet born, 1 for living, 2 for dead.
status <- born + dead

# If dead, this contains the status of the cause.
deadcause <- matrix(dt$cause, nc=length(times), nrow=n) * dead + born

# Function to get animations
anim <- function(dt, times) {
  for(i in seq_along(times)) {

    # Remove those not yet born.
    dtcur <- dt * born[, i]

    scatterplot3d(x=dtcur$race, 
                  y=dtcur$bweight, 
                  z=dtcur$blen, 
                  color=deadcause[, i],
                  angle = 135, type = "h",
                  main=paste("At time", i),
                  xlim=c(0,5), 
                  ylim=c(0,1500), 
                  zlim=c(0,500))
    animation::ani.pause()
  }
}

# Save the gif to current directory.
saveGIF(expr = anim(dt, times), interval=.1, outdir = getwd())