R通過多列進行互相關

Question

我有一個這樣的數據表：

> head(my_data)
     V1    V2    V3    V4    V5
1 36045 49933 41622 29491 34393
2 36874 44752 44158 40561 36045
3 45008 51964 58015 32733 29491
4 44830 72017 60434 40347 40561
5 48553 65470 49933 38842 32733
6 52028 64955 44752 41622 40347

我已經學會了如何通過多列找到相關性：

> head(cor(my_data)[,])
          V1        V2        V3        V4        V5
V1 1.0000000 0.4621777 0.7985130 0.9490929 0.9045297
V2 0.4621777 1.0000000 0.8041824 0.4201712 0.1583757
V3 0.7985130 0.8041824 1.0000000 0.7466672 0.5889458
V4 0.9490929 0.4201712 0.7466672 1.0000000 0.8672321
V5 0.9045297 0.1583757 0.5889458 0.8672321 1.0000000

我已經嘗試了很多，但是無法達到我的目標，即在每對中找到與ccf功能互相關的最大絕對值。 非常感謝您的所有答案！

Answer 1

mat
#         V1    V2    V3    V4    V5
# [1,] 36045 49933 41622 29491 34393
# [2,] 36874 44752 44158 40561 36045
# [3,] 45008 51964 58015 32733 29491
# [4,] 44830 72017 60434 40347 40561
# [5,] 48553 65470 49933 38842 32733
# [6,] 52028 64955 44752 41622 40347

class(mat)
# [1] "matrix"

combins <- combn(colnames(mat), 2)

a1 <- apply(combins, 2,
            FUN = function(x){ccf(mat[, x[1]], mat[, x[2]])})

abs_max_ccf <- unlist(lapply(a1, function(x) abs(max(x$acf))))

names(abs_max_ccf) <- apply(combins, 2, function(x) paste0(x[1], x[2], collapse = ''))

abs_max_ccf
#      V1V2      V1V3      V1V4      V1V5      V2V3      V2V4      V2V5      V3V4      V3V5      V4V5 
# 0.7460529 0.4450512 0.5167570 0.4672099 0.8028452 0.4944933 0.5220862 0.4076768 0.2884272 0.8494897 

驗證結果：從mat ： V1和V2提取兩列，並執行絕對最大值ccf。

abs(max(ccf(mat[, "V1"], mat[, "V2"])$acf))
# [1] 0.7460529