如何使用rpy2從python獲取n維數組

Question

我想使用python進行一些計算，然后將數組數據放入r以得到一些圖。

對於1維數組，我可以使用FloatVector來獲得正確答案，但n維數組錯誤

（運行以下代碼）

（2維數組）
import numpy as np from rpy2.robjects.vectors import FloatVector x = np.array([[1, 2], [3, 4]]) X = FloatVector(x)

錯誤信息：

`Traceback (most recent call last):
 File "<stdin>", line 1, in <module>
 File "D:\Program\Anaconda3\lib\site-packages\rpy2\robjects\vectors.py",   line 456, in __init__
 obj = FloatSexpVector(obj)
 ValueError: Error while trying to convert element 0 to a double.`

使用numpy2ri可能會使某些繪圖順序出錯（例如ggplot2）

我想在間諜中做所有這些。

Answer 1

轉換機制可以是您的朋友：

from rpy2.robjects.conversion import localconverter
from rpy2.robjects import numpy2ri

with localconverter(numpy2ri.converter) as cv:
    X = cv.py2ro(x) # convert from *py*thon to *ro*bjects

否則，發生這種情況是因為rpy2試圖遍歷序列x （默認行為而不請求numpy進行交互），並使迭代中的每個元素成為R / rpy2對象。 這不起作用，因為x[i]被關到FloatVector ，你不能有一個FloatVector的FloatVector元素（你可以有FloatVector名單雖然）。 明確地說，這就是正在發生的情況（您將觸發相同的錯誤）：

FloatVector([FloatVector(y) for y in x])