從python中的VTK文件中檢索facet和point

Question

我有一個包含3d模型的vtk文件，

我想提取點坐標和刻面。

這是一個最小的工作示例：

import vtk
import numpy
from vtk.util.numpy_support import vtk_to_numpy

reader = vtk.vtkPolyDataReader()
reader.SetFileName('test.vtk')
reader.Update()

polydata = reader.GetOutput()

points = polydata.GetPoints()
array = points.GetData()
numpy_nodes = vtk_to_numpy(array)

這可以作為numpy_nodes包含所有點的x，y，z坐標，但我無法檢索將此模型的方面與相應點相關聯的列表。

我試過了：

facets= polydata.GetPolys()
array = facets.GetData()
numpy_nodes = vtk_to_numpy(array)

但是numpy_nodes只是一個一維數組，我期望一個二維數組（大小為3 *小平面的數量），其中第一個維度包含facet對應點的數量（如.ply文件中）。

任何有關如何進行的建議都將受到歡迎

Answer 1

你快到了。 為了允許不同類型的單元格（三角形，四邊形等），numpy數組使用以下方案對信息進行編碼：

numpyArray = [ n_0, id_0(0), id_0(1), ..., id_0(n0-1), 
               n_1, id_1(0), id_1(1), ..., id_1(n1-1), 
               ... 
               n_i, id_i(0), id_i(1), ..., id_1(n1-1), 
               ...
              ]

如果所有多邊形都是同一類型，對於所有i來說都是n_i==n ，只需重新整形1D數組以獲得可解釋的內容：

cells = polydata.GetPolys()
nCells = cells.GetNumberOfCells()
array = cells.GetData()
# This holds true if all polys are of the same kind, e.g. triangles.
assert(array.GetNumberOfValues()%nCells==0)
nCols = array.GetNumberOfValues()//nCells
numpy_cells = vtk_to_numpy(array)
numpy_cells = numpy_cells.reshape((-1,nCols))

可以刪除numpy_cells的第一列，因為它只包含每個單元格的點數。 但其余列包含您要查找的信息。

為了確保結果，請將輸出與“傳統”方法進行比較以收集點ID：

def getCellIds(polydata):
    cells = polydata.GetPolys()
    ids = []
    idList = vtk.vtkIdList()
    cells.InitTraversal()
    while cells.GetNextCell(idList):
        for i in range(0, idList.GetNumberOfIds()):
            pId = idList.GetId(i)
            ids.append(pId)
    ids = np.array(ids)
    return ids

numpy_cells2 = getCellIds(polydata).reshape((-1,3))

print(numpy_cells[:10,1:])
print(numpy_cells2[:10])
assert(np.array_equal(numpy_cells[:,1:], numpy_cells2))