向 NMDS plot 添加 95% 置信區間

Question

我正在嘗試使用代表 95% 置信區間的橢圓的物種群落組成數據的 plot 和 NMDS plot。 我使用 metaMDS 為我的 NMDS plot 生成了數據，並成功地使用 R 中的基本 plot 函數生成了排序（參見下面的代碼）。 但是，我正在努力使用 ggplot2 成功地將我的數據獲取到 plot，這是我在 NMDS 圖上看到 95% CI 繪制的唯一方法。 我希望有人能夠幫助我更正我的代碼，以便省略號顯示 95% CI，或者可以指出我使用其他方法實現這一目標的正確方向？

我繪制 NMDS plot 的基本代碼：

orditorp(dung.families.mds, display = "sites", labels = F, pch = c(16, 8, 17, 18) [as.numeric(group.variables$Heating)], col = c("green", "blue", "orange", "black") [as.numeric(group.variables$Dungfauna)], cex = 1.3)
ordiellipse(dung.families.mds, groups = group.variables$Dungfauna, draw = "polygon", lty = 1, col = "grey90")
legend("topleft", "stress = 0.1329627", bty = "n", cex = 1)

我的任命：

Answer 1

我意識到這個問題很老，但我發現這篇文章對於在我的工作中繪制置信橢圓很有用，也許它會對你有所幫助。 從純素 package 到 NMDS plot134966B87CBZ27D8Z 中繪制的 Ordielipse function