[英]How to predict and extract R Squared with .lm.fit?
正如標題所暗示的那樣,我看到一些用戶提到.lm.fit()
函數具有比常規lm()
更快的速度優勢,但是當我深入了解.lm.fit()
的幫助時,它應該是作為一個更合適的函數,它返回一組列表而不是model ,這讓我認為是否仍然可以提取 R 平方、Adj R 平方等組件,最后從中進行predict()
?
以下是示例數據和執行:
test_dat <- data.frame(y = rnorm(780, 20, 10))
for(b in 1:300){
name_var <- paste0("x",b)
test_dat[[name_var]] <- rnorm(780, 0.01 * b, 5)
}
tic()
obj_lm <- lm(y ~ ., data = test_dat)
print(class(obj_lm))
print(summary(obj_lm)$r.squared)
print(summary(obj_lm)$adj.r.squared)
predict(obj_lm)
toc() #approximately 0.4 seconds
tic()
datm <- as.matrix(test_dat)
obj_lm_fit <- .lm.fit(cbind(1,datm[,-1]), datm[,1])
print(class(obj_lm_fit))
toc() #approximately 0.2 seconds
函數predict
和resid
是通用的,因為.lm.fit
返回 object of class "list"
,你所要做的就是編寫實現你想要的定義的方法。 以下是計算擬合值、殘差和 R^2 的方法。
set.seed(2023) # make the results reproducible
test_dat <- data.frame(y = rnorm(780, 20, 10))
for(b in 1:300){
name_var <- paste0("x",b)
test_dat[[name_var]] <- rnorm(780, 0.01 * b, 5)
}
obj_lm <- lm(y ~ ., data = test_dat)
datm <- as.matrix(test_dat)
obj_lm_fit <- .lm.fit(cbind(1,datm[,-1]), datm[,1])
#------------------------------------------------------------------------
# the methods for objects of class "list"
#
fitted.list <- function(object, X) {
X %*% coef(object)
}
resid.list <- residuals.list <- function(object, X, y) {
y_fitted <- fitted(object, X)
y - y_fitted
}
rsquared <- function(x, ...) UseMethod("rsquared")
rsquared.default <- function(x, ...) {
summary(x)$r.squared
}
rsquared.list <- function(object, X, y) {
e <- resid.list(object, X, y)
1 - sum(e^2)/sum( (y - mean(y))^2 )
}
rsquared(obj_lm_fit, cbind(1,datm[,-1]), datm[,1])
#> [1] 0.3948863
rsquared(obj_lm)
#> [1] 0.3948863
創建於 2023-01-03,使用reprex v2.0.2
添加了計算 adj.R2 的方法
adj_rsquared_list <- function(object, X, y){
r2 <- rsquared.list(object, X, y)
k <- ncol(X) - 1
n <- nrow(X)
rate_of_error <- (1 - r2) * (n - 1) / (n - k - 1)
adj_r2 <- 1 - rate_of_error
return(adj_r2)
}
adj_rsquared_list(obj_lm_fit, cbind(1,datm[,-1]), datm[,1])
#> [1] 0.01590061
在Jovan編輯之后,我將上面的fitted.list
更改為使用coef()
,一個 function 提取第一個 arguments 列表成員"coefficients"
(如果存在),並重寫rsquared
的默認和列表方法以接受adj
參數. 計算調整后的 R^2 的代碼是 Jovan 代碼的復制和粘貼。
rsquared <- function(x, ...) UseMethod("rsquared")
rsquared.default <- function(x, adj = FALSE, ...) {
if(adj) {
summary(x)$adj.r.squared
} else summary(x)$r.squared
}
rsquared.list <- function(object, X, y, adj = FALSE) {
e <- resid.list(object, X, y)
r2 <- 1 - sum(e^2)/sum( (y - mean(y))^2 )
if(adj) {
k <- ncol(X) - 1
n <- nrow(X)
rate_of_error <- (1 - r2) * (n - 1) / (n - k - 1)
adj_r2 <- 1 - rate_of_error
adj_r2
} else r2
}
# same as above
rsquared(obj_lm_fit, cbind(1,datm[,-1]), datm[,1])
#> [1] 0.3948863
rsquared(obj_lm)
#> [1] 0.3948863
# new, `adj = TRUE`
rsquared(obj_lm_fit, cbind(1,datm[,-1]), datm[,1], adj = TRUE)
#> [1] 0.01590061
rsquared(obj_lm, adj = TRUE)
#> [1] 0.01590061
創建於 2023-01-03,使用reprex v2.0.2
聲明:本站的技術帖子網頁,遵循CC BY-SA 4.0協議,如果您需要轉載,請注明本站網址或者原文地址。任何問題請咨詢:yoyou2525@163.com.