醫學影像與 python
[英]Medical Imaging with python
我有一張 DICOM 格式的圖像，該圖像由一組 RAW 文件組成（特定情況下為 122，這將是圖像將具有的切片數，Z 深度）。 圖像的大小為 512x512x122 體素。 我制作的程序使用 pydicom 迭代讀取這些文件。 讀取它們后，我將像素數據存儲在 numpy 數組中，這樣我就可以使用 ...
我需要使用哪個 FHIR 資源？
[英]Which FHIR resource do I need to use?
我正在開發透析應用程序，需要存儲診斷以顯示到表格中，如附圖所示。 誰能提供有關為此使用哪些 R4 FHIR 資源的指導？ 謝謝。 我查看了 FHIR 文檔，但仍然不確定我應該使用 CarePlan 還是 Condition。 非常感激你的幫助。 圖像 ...
Plot 圖表上同一行的兩條線
[英]Plot two lines on the same row on a graph
我正在嘗試創建一個醫學圖表來顯示心率。 它將在左側顯示實時數據，在右側顯示預測預測。 我將從后端 API 獲取兩者，現在我需要在圖表上將它們顯示為一條線。 我正在使用 ReactJs 和 chart.JS。 看下面的圖片可以更好地理解：（ https://i.stack.imgur.com/qWd6 ...
f1_score() 采用 2 個位置 arguments，但給出了 3 個位置 arguments（和 1 個僅關鍵字參數）
[英]f1_score() takes 2 positional arguments but 3 positional arguments (and 1 keyword-only argument) were given
這是錯誤 我嘗試以不同的方式傳遞 arguments 但仍然出現相同的錯誤 ...
選擇最大匹配對
[英]Selecting the maximum matched pairs
我有兩個具有不同 ID 的組，我通過運行一個代碼來查看符合條件的案例，從而獲得了可能的匹配項，但是，它返回了例如來自 A 組的一個 ID，我有多個來自 B 組的匹配項。我想擺脫重復並隨機選擇匹配對，最后達到最大匹配對數。 關於如何解決這個問題的任何想法？ 這是我的代碼： ...
如何執行 3 通道圖像體素明智求和（醫學圖像）
[英]How to perform 3 channel images voxel wise summation (medical images)
在此處輸入圖像描述如您所見。 假設從 3d CNN 模型（如 nn.net）的最后一層預測到左肺、右肺和背景的三個通道圖像。 我想向 the.network 添加一個輔助層，它僅對左右肺部預測圖像通道執行體素匯總但是，我只知道圖像通道的概念，因為RGB顏色是3通道圖像和1通道圖像，只有明暗，所以我 ...
如何對 Nifti 文件進行重組，以便將它們安裝到 CNN 中？
[英]How can Nifti files be restructured so that they can be fitted in a CNN?
我的大多數 Nifti 文件都有不同的 x y Z 尺寸。 我如何安排它們以使它們具有相同的維度，然后能夠在 CNN 中訓練它們？ ...
OpenCV 中的裁剪返回旋轉 90 度的圖像
[英]Cropping in OpenCV return images rotated 90 degrees
我想根據正確的框架裁剪圖像。 我有大約 10000 張手部 X 射線圖像要預處理，到目前為止我做了什么： 在圖像上應用高斯模糊和閾值（二進制 + 大津）。 應用膨脹以獲得單個對象（在本例中為手）。 使用cv2.findContours()沿着手的邊緣繪制輪廓。 使用cv2.boun ...
通過在 OpenCV 中通過中指畫一條線來拉直手部圖像
[英]Straigthening hand images by drawing a line through the middle finger in OpenCV
我想根據中指拉直圖像中的手。 我有大約 10000 張這樣的手部 X 射線圖像要預處理。 到目前為止我所做的預處理： 在圖像上應用高斯模糊和閾值（二進制 + 大津）。 應用膨脹以獲得單個對象（在本例中為手）。 使用cv2.findContours()沿着手的邊緣繪制輪廓。 應用cv ...
自舉生物等效性結果 R
[英]Bootstrapping bioequivalence results R
我正在嘗試使用 3 個葯代動力學參數（AUC0-infinity [ AUCIFO ]、AUClast [ AUCLST ]、Cmax [ CMAX ]）對 R 中的生物等效性研究進行引導模擬。 我想從實際研究數據集中進行替換采樣，以將樣本量從 25 增加到 100，執行 BE 計算（使用BE包中的 ...
使用 opencv 檢測此圖像的計數
[英]detecting countours of this image using opencv
我想檢測白細胞 (WBC) 並對其進行計數，因此我不得不采取一些步驟並達到此圖像，但不知道下一步該做什么。 原圖： 灰色然后關閉形態然后閾值化： 我的代碼 ...
沒有在使用 OpenCV 的 X 射線圖像上的文本/標簽周圍獲得計數框
[英]Not getting a countour box around the texts/tags on an X-ray image with OpenCV
我正在嘗試檢測文本並刪除那些粗字母。 以下鏈接提出了相同的目標： How to detect text on an X-Ray image with OpenCV 。 （“將定向邊界框提取為矩陣”） 兩個示例圖像：示例圖像 #1示例圖像 #2 在這里，必須檢測字體 L、J、C、O（來自第 1 ...
使用skimage python從圖像中選擇具有特定度量的區域（正方形）
[英]Select area (square) with spicific measure from an image using skimage python
我正在嘗試從圖像（肺圖像）中提取 3 個區域，這些區域在軟組織中表示，每個區域將是特定高度和寬度的正方形，例如寬度和高度為 10mm，如下圖所示， 如圖所示，該區域也是同質的，這意味着它只包括相同的顏色（在這種情況下是軟組織） 如何使用 skimage 或 cv2 之類的 python 庫來做 ...
GPT-3：醫學類似物
[英]GPT-3: a medical analogue
有沒有類似的東西可以像優秀的醫生一樣回答？ 還是愛因斯坦，還是古希臘？ 我可以在哪個 URL 找到所有這些可能性的列表？ 我剛剛發現了 GPT-3，我對它感到驚訝。 ...
如何將兩個心電圖測量值轉換為頻率為 20 赫茲的心率
[英]How to convert two ECG measurments to HR with frequency 20 hz
我有兩個 ECG 傳感器的數據，頻率為 50hz。 我想將其轉換為頻率為 20hz 的 HR 信號。 我已經嘗試過 heartpy 的解決方案，但我無法在低頻下獲得良好的 HR 值。 有人有我如何在 python 中實現這個的例子嗎？ 數據如下所示：信號輸入的 Pandas dataframe ...
用於傳輸數據的 BLE 場景
[英]BLE scenario for transferring data
我有一個關於 BLE 的問題。 這是我第一次嘗試使用 BLE，我正在探索一些用於醫療設備的高級設計。 該結構將是設備通過 BLE 連接到獨立的控制器設備（wifi 禁用）。 該設備將在 24 小時內收集心率等數據。 在某些時候，獨立的 controller 將與設備斷開連接並連接到應用程序以傳輸收集 ...
如何提高 CNN 分類中的 F1-score
[英]How to improve the F1-score in CNN classification
我的項目是關於腦部核磁共振掃描的分類。 重要的是，我的 model 更多的是誤報而不是誤報，因為我正在處理醫療數據。 最好是誤檢腫瘤而不是。 我的問題是如何提高 f1 分數。 腦部核磁共振掃描我嘗試了什么：1）我對腫瘤 class 采樣不足 -> 這將我的 f1 分數提高了 1% 數據集： ...
我可以制作一個在其他數據集上預訓練的基於轉換器的聊天機器人嗎？
[英]Can I make a transformer based chatbot which is pretrained on some other dataset?
我目前正在從本頁的教程中制作一個醫療變壓器聊天機器人： https://blog.tensorflow.org/2019/05/transformer-chatbot-tutorial-with-tensorflow-2.html 我正在使用醫學問題/答案的文本語料庫。 當我訓練 model 並 ...
什么以及如何在訓練 GAN 中假裝這些工件
[英]What and how to pretend these artifacts in Training GAN
目前我正在訓練 3D 補丁，如圖所示。 此刻我想知道邊緣上的這些文物是從哪里來的？ 我的直覺說這可能是反卷積，但我不知道如何防止它。 3D 補丁的中間一片 ...