在macOS Sierra上使用Homebrew安装卡在错误加载scipy上

Question

当我尝试执行以下操作时会发生这种情况：

import scipy.io

另一个scipy模块，例如scipy.sparse，似乎还可以。

根本错误是：

packages/scipy/special/__init__.py", line 636, in <module>
        from ._ufuncs import *
    ImportError: dlopen(/usr/local/lib/python2.7/site-packages/scipy/special/_ufuncs.so, 2): Symbol not found: ___addtf3

完整的堆栈跟踪：

Traceback (most recent call last):
  File "HistogramClassifier.py", line 3, in <module>
    import scipy.io
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/scipy/io/__init__.py", line 97, in <module>
    from .matlab import loadmat, savemat, whosmat, byteordercodes
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/scipy/io/matlab/__init__.py", line 13, in <module>
    from .mio import loadmat, savemat, whosmat
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/scipy/io/matlab/mio.py", line 12, in <module>
    from .miobase import get_matfile_version, docfiller
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/scipy/io/matlab/miobase.py", line 22, in <module>
    from scipy.misc import doccer
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/scipy/misc/__init__.py", line 51, in <module>
    from scipy.special import comb, factorial, factorial2, factorialk
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/scipy/special/__init__.py", line 636, in <module>
    from ._ufuncs import *
ImportError: dlopen(/usr/local/lib/python2.7/site-packages/scipy/special/_ufuncs.so, 2): Symbol not found: ___addtf3
  Referenced from: /usr/local/lib/python2.7/site-packages/scipy/special/../.dylibs/libquadmath.0.dylib
  Expected in: /usr/lib/libSystem.B.dylib
 in /usr/local/lib/python2.7/site-packages/scipy/special/../.dylibs/libquadmath.0.dylib

就是这样。 Google返回了很多匹配，但它们要么很旧，要么不是同一个lib，要么是我尝试过的东西。 这篇文章的其余部分是到目前为止我发现/尝试过的所有无法使用的东西。

仔细检查python：

which python
/usr/local/bin/python

ls -l /usr/local/bin/python
lrwxr-xr-x  ... /usr/local/bin/python -> ../Cellar/python/2.7.13/bin/python

我当前未使用虚拟环境。

我认为自制软件还可以：

brew doctor
Your system is ready to brew.

这是尝试后：

brew update
brew upgrade

我还尝试了通过brew和pip卸载并重新安装scipy软件包。

我尝试了其他各种方法，但不想弄乱可正常工作的Homebrew设置。

据我所知，谷歌带回了有关“眼镜蛇”的较早帖子。 “哪个眼镜蛇”什么也不会返回。

Google的其他事情都在谈论库路径的顺序，但这似乎是在使用内置的python，我认为这并不适用，因为我相信我正在使用Homebrew的版本。

显然，它与可能与fortran相关的库有关，但是要键入什么来修复它……不知道从哪里开始。

Answer 1

尝试以下操作：临时删除/usr/lib/libSystem.B.dylib，然后重新安装scipy。