标记和编码数据集使用太多 RAM

Question

尝试对数据进行标记和编码以提供给神经网络。

我只有 25GB 的 RAM，每次我尝试在我的 google colab 崩溃下运行代码时。 知道如何防止他的发生吗？ “您的 session 在使用所有可用 RAM 后崩溃”

我认为标记/编码 50000 个句子的块会起作用，但不幸的是没有。 该代码适用于长度为 130 万的数据集。 当前数据集的长度为 500 万。

max_q_len = 128
max_a_len = 64    
trainq_list = train_q.tolist()    
batch_size = 50000
    
def batch_encode(text, max_seq_len):
      for i in range(0, len(trainq_list), batch_size):
        encoded_sent = tokenizer.batch_encode_plus(
            text,
            max_length = max_seq_len,
            pad_to_max_length=True,
            truncation=True,
            return_token_type_ids=False
        )
      return encoded_sent

    # tokenize and encode sequences in the training set
    tokensq_train = batch_encode(trainq_list, max_q_len)

分词器来自 HuggingFace：

tokenizer = BertTokenizerFast.from_pretrained('bert-base-multilingual-uncased')

Answer 1

无论大小如何，您都应该使用生成器并将数据传递给tokenizer.batch_encode_plus 。

从概念上讲，是这样的：

培训清单

这可能包含从某些文件中读取的句子列表。 如果这是一个大文件，您可以按照这个答案懒惰地读取部分输入（最好一次读取batch_size行）：

def read_in_chunks(file_object, chunk_size=1024):
    """Lazy function (generator) to read a file piece by piece.
    Default chunk size: 1k."""
    while True:
        data = file_object.read(chunk_size)
        if not data:
            break
        yield data

否则打开单个文件（比 memory 小得多，因为使用 BERT 编码后它会大得多），如下所示：

import pathlib


def read_in_chunks(directory: pathlib.Path):
    # Use "*.txt" or any other extension your file might have
    for file in directory.glob("*"):
        with open(file, "r") as f:
            yield f.readlines()

编码

编码器应该使用这个yield器并返回编码部分，如下所示：

# Generator should create lists useful for encoding
def batch_encode(generator, max_seq_len):
    tokenizer = BertTokenizerFast.from_pretrained("bert-base-multilingual-uncased")
    for text in generator:
        yield tokenizer.batch_encode_plus(
            text,
            max_length=max_seq_len,
            pad_to_max_length=True,
            truncation=True,
            return_token_type_ids=False,
        )

保存编码文件

由于文件太大而无法放入 RAM memory，您应该将它们保存到磁盘（或在生成时以某种方式使用）。

沿着这些思路：

import numpy as np


# I assume np.arrays are created, adjust to PyTorch Tensors or anything if needed
def save(encoding_generator):
    for i, encoded in enumerate(encoding_generator):
        np.save(str(i), encoded)