如何關聯 NIFTI 格式的不同 MRI 序列圖像？

Question

我是醫學影像方面的新手。 我正在處理 MRI 圖像，即 T2 和 DWI。

我用nib.load上傳了兩張圖片，但每張序列圖片都有不同數量的切片（體積、深度？）。 如果我 select 一個切片（z坐標），如何在另一個序列圖像上得到相應的切片？ ITK 做對了，所以也許 NIFTI header 中的某些內容可以提供幫助？

非常感謝您的閱讀，我也嘗試了插值。 但它沒有用。

Answer 1

如果 ITK 做對了，為什么不直接使用 ITK？

如果您堅持手動滾動自己的索引 <-> 物理空間轉換例程，請查看 ITK 如何計算這些矩陣以及使用它們的公開訪問方法。 對於特定於 NIFTI 的信息，請查看 ITK 的NIFTI 閱讀器，它在itk::Image中設置了相關的元數據。

Answer 2

讀取 NIFTI，即仿射，並提取平移轉換矩陣以創建從 T2 到 DWI 體素的映射。

提示：nibabel。