如何正確解釋具有大 z 統計信息/沖突錯誤消息的 glmmTMB 模型？
[英]How to correctly interpret glmmTMB models with large z statistics/conflicting error messages?
我正在使用glmmTMB運行一個零膨脹的雙分量障礙 model 以確定某些協變量可能如何影響（1）魚的胃中是否有食物以及（2）如果胃中有食物，協變量會影響數量在它的胃里發現的獵物。 我的數據包括一條魚被捕獲的年份、捕獲的季節、性別、狀況、原產地、總海齡（1SW = 海上一年，MSW = 海上多年） ...
使用截斷計數從 glmmTMB 進行預測
[英]Predicting from glmmTMB with truncated counts
我正在運行具有各種截斷計數分布（ truncated_poisson 、 truncated_compois 、 truncated_nbinom1 、 truncated_nbinom2 ）的 glmmTMB model。 當我根據 model 進行預測時，這些值似乎低於預期，好像預測沒有考慮截斷 ...
glmmTMB_phylo：Matrix::rankMatrix(TMBStruc$data.tmb[[whichX]]) 錯誤：長度(d <- dim(x)) == 2 不正確
[英]glmmTMB_phylo: Error in Matrix::rankMatrix(TMBStruc$data.tmb[[whichX]]) : length(d <- dim(x)) == 2 is not TRUE
我正在嘗試運行以下 model： 但我不斷收到錯誤： 我發現的其他可重現示例 ( data ) 也會出現此錯誤。 在我運行 model 之前，我剛剛加載了我的數據（ data和supertree ）並從supertree計算了一個 Z 矩陣： 我已經通過以下方式安裝了開發版本： 但沒有成功。 我的超 ...
glmmTMB model 的似然比？
[英]Likelihood ratio for glmmTMB model?
我有一個混合的 model，我試圖在其中找到隨機效應的重要性。 model 是我使用 R package glmmTMB 構建的具有零膨脹 beta 分布的混合 model，具有以下 function： 我試圖找出變量“Xnumber”的意義。 我讀過我需要做的是似然比檢驗，但不知道如何使用 g ...
Model 與 beta 系列的 glmmTMB 對象的比較
[英]Model comparison for glmmTMB objects with beta family
我們正在使用 glmmTMB package 執行 beta 混合效應回歸分析，如下所示： 接下來，我們要運行 model 比較——類似於用於“lm”對象的“step”function。 到目前為止，我們從 MuMIn package 中找到了 function 'dredge'，它根據標准（例如 ...
具有 beta 分布且 y 變量中有很多零的 GLMM
[英]GLMM with beta distribution and lots of zeros in y variable
我正在嘗試使用 glmmTMB function（包 glmmTMB）運行帶有 beta 發行版的 glmm。 我的響應變量有很多 0 觀察，所以在運行 model 時出現此錯誤 eval 中的錯誤（family$initialize）：y 值必須為 0 < y < 1 我附上了我的響 ...
glmmTMB：因素交互的成對比較事后檢驗
[英]glmmTMB: Pairwise comparison post-hoc tests for factors interaction
在我的例子中： 首先安裝ziGamma model： 使用 DHARMa 檢查調整： 看起來不錯成對比較事后測試： 好的，它可以工作，但我想知道是否可以直接與最終的 model ( mTCFd ) 進行成對比較，而無需新的交互 model 調整 ( mTCFd.int )。 請問，有什么幫助嗎？ ...
在 merMod 上的 bootstrap_parameters/model 中使用“snow”並行操作 object (R)
[英]Using "snow" parallel operations in bootstrap_parameters/model on merMod object (R)
我一直在使用 glmmTMB 生成的廣義線性混合模型上使用 bootstrap_parameters（R 中的參數 package）。 這些在沒有並行處理的情況下工作正常（parallel =“no”），並且在我使用 parallel =“multicore”的舊的和慢速 mac 上也工作正常。 ...
混合 glm 零膨脹模型的 Bootstrap 方法
[英]Bootstrap method for mixed glm zero-inflated model
我想使用glmmTMB包引導混合 glm 零膨脹模型（ m_F ），但是盡管使用coef或fixef來指定系數，但我總是輸出錯誤： 我的例子： 請問有什么辦法嗎？ ...
計算邊際效應：為什么 ggeffect 和 ggemmeans 給出不同的答案？
[英]Computing marginal effects: Why does ggeffect and ggemmeans give difference answers?
例子 問題 為什么 ggeffect 和 ggemmeans 對邊際效應給出不同的結果？ 包的含義和效果如何計算它們只是內部的東西嗎？ 另外，有沒有人知道一些關於如何從頭開始為示例中的模型計算邊際效應的資源？ ...
為什么在使用“glmmTMB”函數調整 glmm 時出現以下錯誤，並且我嘗試獲取置信區間？
[英]Why am getting the following error when adjusting a glmm with the "glmmTMB" function and I try to obtain the confidence intervals?
我正在嘗試運行以下模型： 但是當我嘗試獲取置信區間時出現此錯誤： 有誰知道這個問題可能是什么？ ...
glmmTMB 關於隨機效應的預測誤差
[英]glmmTMB predictions error concerning random effect
我正在嘗試使用 glmmTMB 創建一個帶有模型預測的柵格。 這是基於一個模型和一個光柵堆棧。 我將柵格堆棧轉換為數據框，因為我認為這是函數predict.glmmTMB運行的要求。 該模型 model6 <- glmmTMB(Used~scale(Road_density)+scale(n ...
兩個隨機截取時的 ggcoef_model 錯誤
[英]ggcoef_model error when two random intercepts
當試圖用 GGally 中的兩個隨機截距GGally glmmTMB模型的條件固定效應時，我得到了錯誤： 調用“tidy_fun()”時出錯。 這很可能是因為“tidy_fun=”中提供的函數拼寫錯誤、不存在、與您的對象不兼容或缺少必要的參數（例如“conf.level=”或“conf.int ...
當我嘗試在 glmm 中包含線性變量時，Summary() 返回 NaN 值
[英]Summary() returns NaN values when I try to include a variable as linear in a glmm
我正在嘗試使用glmmTMB運行模型。 當我包含 avgt60 時，它在模型中做了一些奇怪的事情，我不確定為什么。 當我將它作為非多邊形項包含時，它給了我 NaN 值。 當我將它作為一個 poly() 項包含在內時，它會拋出整個模型。 當我排除它時，它似乎很好......我是這種工作的新手，所以任何 ...
GlmmTMB model 和 emmeans
[英]GlmmTMB model and emmeans
我是 glmmtmb 模型的新手，所以遇到了問題。 我構建了一個 model，然后基於 AICtab 和 DHARMa，這是最好的： 在 glmmTMB 之后，我運行了 Anova（來自 Car），然后是 emmeans，但是 emmeans 中 p 值的結果是相同的（不是 lower.CL 或 ...
如何在多變量中結合邏輯和泊松 model
[英]how to combine logistic and poisson in a multivariate model
如何在一個 model 中同時使用邏輯回歸和泊松回歸方法編寫多元零膨脹 model？ 結果應如下所示： 在本文中，這是由 SAS9.3 中的 PROC NLMIXED 完成的。 我如何使用 r 中的 glmmTMB package 執行此操作？ ...
帶有 glmmTMB 的 tab_model() 的奇怪輸出
[英]Weird output of tab_model() with glmmTMB
當我使用glmmTMB包的tab_model()函數與sjPlot包的glmmTMB函數來擬合具有 beta 系列響應的廣義線性混合模型時，我得到了一個奇怪的輸出。 截距和邊際 R² 看起來很奇怪。 這里發生了什么？ df <- structure(list(date = structure ...
為什么在RStudio 2022.02.0版本運行glmmTMB()會報錯？
[英]Why there is an error when running glmmTMB() in RStudio version 2022.02.0?
我正在嘗試運行泊松 GLMM model： 但我收到一條錯誤消息： Error in.Call("getParameterOrder", data, parameters, new.env(), PACKAGE = DLL): arguments (3) 的數量不正確，'getParameter ...
如何使用 GLM 泊松 output 計算百分比變化
[英]How to calculate % change with GLM Poisson output
背景：我有計數數據（甲蟲計數），我正在研究處理梯度對計數數據的影響。 梯度是一個連續的預測變量，由“7個級別”組成（即-100%減少、-80%減少、-60%減少、-40%減少、-20%減少、0%減少和50%增加） . '0% 減少'意味着沒有變化，或者這就是控制。 我想使用 GLM output ...