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无法使用 lmfit 拟合自定义 model - ValueError:model function 生成的 NaN 值和拟合中止 - Unable to fit custom model with lmfit - ValueError: The model function generated NaN values and the fit aborted

我有这个数据: 数据看起来像这样,拟合是手动调整的: 我想适应这个自定义日志 function: 我尝试了两种方法: 和 但两者都会导致相同的错误: ValueError: The model function generated NaN values and the fit aborted. P ...

2023-01-20 08:21:53   1   18    python / lmfit  
读取一个 hdf5 文件,使用 Numpy 和 lmfit 使一些进程通过使用 multiprocessing 加速 - Reading a hdf5 file, make some processes with Numpy and lmfit accelerated by using multiprocessing

如果你们中的任何一个可以提供帮助,我将不胜感激。 我正在努力使用多处理来加速保存为相对较大的 hdf5 文件 (4.3 GB) 的数据集的高斯拟合(使用 lmfit)。 请看下面的代码: 如果我在没有多处理的情况下运行,它可以工作,但它太慢了。 但是,当我尝试使用多处理 package(下面的代码) ...

是否可以限制 lmfit 的准确性? - Is it possible to limit the accuracy of lmfit?

我想问一些关于 lmfit 准确性的问题(并可能通过获得答案获得更好的拟合结果)。 所有实验光谱都受到采样的限制,即 x 轴方向上两点之间的距离。 我注意到(到目前为止)有两个 lmfit 试图克服此限制的实例,这给我带来了问题: 当峰的 FWHM 趋于零时。 我假设如果任意两个相邻点相隔 0.0 ...

lmfit 库中的类、属性和函数 - Classes, attributes and functions in lmfit library

我有一个普遍的问题,我不知道如何导航库模块以获得我想要的结果。 这是我的意思的一个例子:假设我使用 lmfit 库来拟合 function: 现在,如果我想具体 select 最佳拟合结果的标准误差之一,我会做这样的事情: 我知道这是正确的,因为我已经尝试过并且它有效,但我不知道如何通过阅读原始库代 ...

在 python 中使用 lmfit 中的 Voigt 配置文件拟合数据 - 巨大错误 - Fitting data with Voigt profile in lmfit in python - huge errors

我正在尝试使用 Voigt 配置文件(Python 中的 lmfit)拟合一些 RIXS 数据,并且我已按以下方式定义了 Voigt 配置文件: 我在 Python 中使用了这个定义而不是流行的 Voigt 配置文件定义: 因为它让我更清楚地了解峰的强度等。 现在,我有几个具有 9-10 个峰的光谱 ...

用等于 0 的 function 拟合数据,无法转换为 f(x) = x 的形式 - Fit data with a function that equals 0 and could not be converted to the form f(x) = x

我在 pandas dataframe 中有 2 列和 31 行。我想要 plot 这个 x,y 数据并将它们拟合到具有 4 个参数的复杂 function。 function 看起来像这样。 function 必须为 0 我有兴趣拟合参数 N,p0,Vp 我尝试使用 Lmfit 并将我的 fu ...

如何使用 lmfit 实现掩码数组拟合(之前使用 curve_fit 的 sigma 选项) - How to implement masked array fitting using lmfit (prior using sigma option of curve_fit)

我正在尝试使用lmfit实现掩码数组拟合。 之前我使用以下代码片段使用curve_fit 。 由于行长,我省略了def spec 。 本质上,定义def spec是 function,它执行 50 次模板插值。 观测数据和模板都具有文件结构x=wavelength , y=flux从x=500到x ...

拟合时省略值 (lmfit nan_policy) - Omit values when fitting (lmfit nan_policy)

假设我有一个带有底层高斯和一些噪音的信号。 装修当然没问题: 现在说出于某种任意原因我的信号被切断了。 我的高斯形信号的某些部分丢失(一些饱和效应)。 现在用相同的程序拟合会导致错误的拟合。 这是有道理的,因为考虑了饱和值。 我如何避免这种情况的想法是用None替换饱和度值,然后使用nan_p ...

拟合常微分方程的曲线 - curve fitting to an ordinary differential equation

我想将曲线拟合到如下所示的 ODE - dA/dt = k1*profit + k2 我有观察到的变量A和profit的时间序列,我想在 python 中使用曲线拟合技术获得k1和k2的最佳值。 我可以为此编写下面的代码,但是解决方案不太合适,或者我的方法可能是错误的。 20 年期间的利润 ...

模型缩放以获得大约 1 的卡方的问题 - Problem with scaling of model to obtain Chi-squared around 1

我很难找到拟合优度,据我所知,减少的 R^2 代表拟合优度,它必须在 1 左右。但就我而言,它是 0.033。 我有3个问题: 1-我的模型在拟合模型中考虑数据的实验不确定性是否正确? 2-如何将减少的 R^2 缩放到 1 左右? 正如我所读到的,我必须找到更好的缩放比例,但如果我正在处理 ...


 
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