用圆圈标记图像中的选定像素

Question

我有一张图像，我必须用圆圈标记强度值小于阈值的像素。 你是怎么做到的，Scatter plot 不起作用，因为我们需要两个输入。 感谢您提供这方面的帮助。

matrix = np.matrix([row1,row2,row3,row4,row5,row6,row7,row8,row9,row10,row11,row12])
matrix_s = matrix<=1 # array containing pixels with value less than threshold
#plotting
plt.imshow(matrix)
plt.colorbar()
plt.plot(matrix_s, marker='o') # this won't work as it will join points with line and is not properly scaled with image 
plt.show()

Answer 1

您可以使用 matplotlib 中的Circle补丁 function（请参阅此处的文档）。

这是一个受您提供的代码启发的示例：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

matrix = np.random.choice(80,size=(10,10))/20

fig,ax=plt.subplots()
im=ax.imshow(matrix,aspect='equal',interpolation=None,origin='lower')
for i in range(matrix.shape[0]):
  for j in range(matrix.shape[1]):
    if matrix[i,j]<=1:
      ax.add_patch(plt.Circle([j,i], radius=0.5, edgecolor='r',lw=3, fill=False))
cbar=plt.colorbar(im)

output 给出：